24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1467  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

cyx0516

木虫 (正式写手)

[求助] plat331,420,417,245,checkcif的A类和B类错误 已有2人参与

请各位帮忙解决这几个A类和B类错误
PLAT331_ALERT_2_B Small Average Phenyl   C-C Dist. C22    -C27           1.35 Ang.
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O11    -   H11C   ...     Please Check
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D       H29C   ..  H29C    ..       1.57 Ang.
PLAT245_ALERT_2_B U(iso) H29C    Smaller than U(eq) O29     by ...      0.062 AngSq
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cyx0516

木虫 (正式写手)

还好,这些问题都解决了
6楼2015-04-30 17:03:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
cyx0516: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢 2014-04-26 19:32:39
第一个问题,C22-C27之间距离太短了, 试试 dfix 1.38 0.01 C22 C27
第二个和第三个问题,加氢有问题,重新加,寻找合适取向的氢,比如水上的氢呈V字形,envi看看O周围的键长键角,
第四个问题,把H29C的Ueq改成-1.5
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
2楼2014-04-25 15:06:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
cyx0516: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢 2014-04-26 19:33:06
cyx0516: 金币+10 2014-04-28 11:54:34
从你这几个错误来看,数据好像不是太好,第一个可以通过dfix命令解决,如果1.38不行的话,你可以试试1.40;第二个问题可以不用解决,某些官能团不能形成氢键也很正常;第三个问题是O29上的H29c和本身对称操作的H29c距离太近,这个问题可能是你加氢有问题,也可能是氢原子的个数不对,比如O29上没有氢,具体要看结构;第四个问题是你的H也按异性精修了,应该修各项同性,限制其Ueq为-1.5000。
3楼2014-04-25 22:13:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cyx0516

木虫 (正式写手)

PLAT331_ALERT_2_B Small Average Phenyl   C-C Dist. C22    -C27           1.35 Ang.
我用了dfix命令,1.38和1.40都用了,但错误仍旧在,不知再有没有别的方法,这是苯环上相邻的两个C
谢谢
4楼2014-04-28 11:54:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 294求调剂 +5 淡然654321 2026-04-17 6/300 2026-04-17 11:04 by wanghanlu
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀,最好在一个月之内的,研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 5/250 2026-04-17 10:02 by bobvan
[考研] 297,工科调剂?河南农业大学本科 +14 河南农业大学-能 2026-04-14 14/700 2026-04-16 14:41 by dingyanbo1
[考研] 初试324 中药学 一志愿天中医 求调剂 +4 李的Lucky 2026-04-10 4/200 2026-04-16 09:22 by fqwang
[考研] 求调剂 +11 小聂爱学习 2026-04-11 15/750 2026-04-15 21:57 by noqvsozv
[考研] 297,工科调剂? +10 河南农业大学-能 2026-04-14 10/500 2026-04-15 21:50 by noqvsozv
[考研] 一志愿A区211,22408 321求调剂 +6 随心所欲☆ 2026-04-15 7/350 2026-04-15 21:45 by lbsjt
[考研] 310求调剂 +16 666真好 2026-04-11 18/900 2026-04-15 13:28 by 黑科技矿业
[考研] 272分材料子求调剂 +41 Loy0361 2026-04-10 54/2700 2026-04-14 18:00 by lhj2009
[考研] 化工学硕294分,求导师收留 +32 yzyzx 2026-04-12 36/1800 2026-04-14 17:45 by lhj2009
[考研] 271求调剂 +35 2261744733 2026-04-11 41/2050 2026-04-14 15:36 by zs92450
[考研] 考研求调剂 +6 ban班小七 2026-04-11 6/300 2026-04-14 14:06 by 哆啦A梦只是个梦
[考研] 食品与营养(0955)271求调剂 +15 升格阿达 2026-04-12 16/800 2026-04-14 13:18 by 浮若_安生
[考研] 农学0904 312求调剂 +4 Say Never 2026-04-11 4/200 2026-04-14 09:10 by zs92450
[考研] 300分求调剂 (085501机械专硕,本科扬大) +9 xu@841019 2026-04-11 10/500 2026-04-14 08:48 by 木木mumu~
[考研] 0854调剂 +10 长弓傲 2026-04-11 11/550 2026-04-13 10:38 by wp06
[考研] 调剂结束 +6 floriea 2026-04-12 8/400 2026-04-12 18:13 by zhouxiaoyu
[考研] 331求调剂 +5 王国帅 2026-04-11 5/250 2026-04-11 22:56 by 溪涧流水
[考研] 一志愿985机械学硕380求调剂 +5 关关雎鸠10 2026-04-11 5/250 2026-04-11 10:10 by 知念。A
[考研] 309求调剂 +14 wdhw 2026-04-10 15/750 2026-04-10 21:06 by zhouxiaoyu
信息提示
请填处理意见