24小时热门版块排行榜    

查看: 2033  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

影月beatrice

铁虫 (初入文坛)

[求助] 关于fix shake以及compute命令的应用问题 已有1人参与

我最近写了一个关于超临界水的in文件,里面用到了fix shake命令,但运行的时候一直报错ERROR: Invalid fix style,我对照manuel检查了命令格式,没有发现问题,禁了fix shake后运行又出现ERROR: Invalid compute style,都没查出问题在哪里,请各位大侠不吝赐教,小女子先谢过了
以下是我的in文件
units real
dimension 3
boundary p p p
atom_style full
pair_style lj/charmm/coul/charmm 7.5 8.0 8.0 10.0
bond_style harmonic
angle_style harmonic
read_data data.Mol
angle_coeff 1  55.0000   104.5200
bond_coeff  1  450.0000   0.9572
pair_coeff 1 1 0.1521 3.1507
pair_coeff 1 2 0.0836 1.7753
pair_coeff 2 2 0.0460 0.4000
region 1 block INF INF INF INF INF INF
velocity all create 640 100
velocity all scale 640
#group water type 1 2
fix 1 all shake 0.0001 20 0 b 1 a 1
fix 2 all npt temp 640 760 1000 iso 236.92 236.92 1000 drag 1
timestep 0.01
compute 1 all ke
compute 2 all pe
compute 3 all temp
compute 4 all dilatation/atom
compute 5 all displace/atom
thermo 500
thermo_style custom temp press density vol pe ke etotal enthalpy
run 1000

data文件如下
LAMMPS data file from msi2lmp v3.8 for Mol

      6 atoms
      4 bonds
      2 angles
      0 dihedrals
      0 impropers

   2 atom types
   1 bond types
   1 angle types

    -0.854007846     3.056692154 xlo xhi
    -0.764937233     3.145762767 ylo yhi
    -1.347689527     2.563010473 zlo zhi

Masses

   1  15.999400
   2   1.007970

Atoms

      1      1   1 -0.798200     0.121798883     0.387575451     0.043193656   0   1   0
      2      1   2  0.399100     0.308427222     1.054689176    -0.656528781   0   1   0
      3      1   2  0.399100     0.163119246    -0.433256524    -0.481969457   0   1   0
      4      2   1 -0.798200     1.973583684     2.001768480     1.988670964   0  -1   0
      5      2   2  0.399100     2.453643042     1.441265665     1.343893247   0  -1   0
      6      2   2  0.399100     1.587480847     2.690434354     1.408703210   0  -1   0

Bonds

     1   1      1      2
     2   1      1      3
     3   1      4      5
     4   1      4      6

Angles

     1   1      2      1      3
     2   1      5      4      6
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

哦买噶等

新虫 (小有名气)

楼主解决这个问题了吗?求指点啊

发自小木虫IOS客户端
4楼2019-09-08 10:22:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

yuexiaoming

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

fix shake 所需要的rigid panckage 出问题了
2楼2014-08-28 17:10:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dgwfly

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yuexiaoming at 2014-08-28 17:10:53
fix shake 所需要的rigid panckage 出问题了

我也遇到类似的问题了,但已安装rigid package,可还是显示unknown fix shake style

发自小木虫IOS客户端
3楼2017-07-12 01:42:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 uKOSCocCb6Fm 2026-11-12 5/250 2026-11-15 03:21 by xSrQNSSjcgoX
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 uKOSCocCb6Fm 2026-11-12 9/450 2026-11-15 02:04 by xSrQNSSjcgoX
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-15 00:24 by Equinoxhua
[考博] 考博求助 10+3 社会实践对别 2026-11-08 3/150 2026-11-13 14:04 by 沐小虫252
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 gRND4NVAZ8VG 2026-11-11 5/250 2026-11-13 11:15 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 6/300 2026-11-13 11:04 by Equinoxhua
[教师之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 6/300 2026-11-13 04:21 by Equinoxhua
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 13:02 by ECLTXnJnRSXf
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 12:51 by ECLTXnJnRSXf
[基金申请] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 7/350 2026-11-12 11:33 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 7/350 2026-11-12 11:31 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 czAiolzR0IJC 2026-11-10 9/450 2026-11-12 11:11 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 8/400 2026-11-12 11:00 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 7/350 2026-11-12 10:49 by HajghKOMynmz
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-12 10:49 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 8/400 2026-11-12 10:16 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 4/200 2026-11-12 06:03 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 8/400 2026-11-12 05:00 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +6 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 7/350 2026-11-12 00:44 by 9fOTqj074tIg
[考博] 申请环境,微生物方向博士 +3 浅笑09 2026-11-08 3/150 2026-11-10 12:44 by 可淡不可忘
信息提示
请填处理意见