24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1831  |  回复: 3

影月beatrice

铁虫 (初入文坛)

[求助] 关于fix shake以及compute命令的应用问题 已有1人参与

我最近写了一个关于超临界水的in文件,里面用到了fix shake命令,但运行的时候一直报错ERROR: Invalid fix style,我对照manuel检查了命令格式,没有发现问题,禁了fix shake后运行又出现ERROR: Invalid compute style,都没查出问题在哪里,请各位大侠不吝赐教,小女子先谢过了
以下是我的in文件
units real
dimension 3
boundary p p p
atom_style full
pair_style lj/charmm/coul/charmm 7.5 8.0 8.0 10.0
bond_style harmonic
angle_style harmonic
read_data data.Mol
angle_coeff 1  55.0000   104.5200
bond_coeff  1  450.0000   0.9572
pair_coeff 1 1 0.1521 3.1507
pair_coeff 1 2 0.0836 1.7753
pair_coeff 2 2 0.0460 0.4000
region 1 block INF INF INF INF INF INF
velocity all create 640 100
velocity all scale 640
#group water type 1 2
fix 1 all shake 0.0001 20 0 b 1 a 1
fix 2 all npt temp 640 760 1000 iso 236.92 236.92 1000 drag 1
timestep 0.01
compute 1 all ke
compute 2 all pe
compute 3 all temp
compute 4 all dilatation/atom
compute 5 all displace/atom
thermo 500
thermo_style custom temp press density vol pe ke etotal enthalpy
run 1000

data文件如下
LAMMPS data file from msi2lmp v3.8 for Mol

      6 atoms
      4 bonds
      2 angles
      0 dihedrals
      0 impropers

   2 atom types
   1 bond types
   1 angle types

    -0.854007846     3.056692154 xlo xhi
    -0.764937233     3.145762767 ylo yhi
    -1.347689527     2.563010473 zlo zhi

Masses

   1  15.999400
   2   1.007970

Atoms

      1      1   1 -0.798200     0.121798883     0.387575451     0.043193656   0   1   0
      2      1   2  0.399100     0.308427222     1.054689176    -0.656528781   0   1   0
      3      1   2  0.399100     0.163119246    -0.433256524    -0.481969457   0   1   0
      4      2   1 -0.798200     1.973583684     2.001768480     1.988670964   0  -1   0
      5      2   2  0.399100     2.453643042     1.441265665     1.343893247   0  -1   0
      6      2   2  0.399100     1.587480847     2.690434354     1.408703210   0  -1   0

Bonds

     1   1      1      2
     2   1      1      3
     3   1      4      5
     4   1      4      6

Angles

     1   1      2      1      3
     2   1      5      4      6
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuexiaoming

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

fix shake 所需要的rigid panckage 出问题了
2楼2014-08-28 17:10:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dgwfly

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yuexiaoming at 2014-08-28 17:10:53
fix shake 所需要的rigid panckage 出问题了

我也遇到类似的问题了,但已安装rigid package,可还是显示unknown fix shake style

发自小木虫IOS客户端
3楼2017-07-12 01:42:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

哦买噶等

新虫 (小有名气)

楼主解决这个问题了吗?求指点啊

发自小木虫IOS客户端
4楼2019-09-08 10:22:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 影月beatrice 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0854求调剂 +22 门路摸摸 2026-04-15 26/1300 2026-04-18 23:30 by 路病情
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考博] 申博/考博 +3 啃面包的小书虫 2026-04-17 4/200 2026-04-17 23:54 by 阳阳阳^_^
[考博] 求博导|生物质基多孔碳/超级电容方向,已有相关成果,寻能源材料/碳材料方向老师 +3 猪猪人Zzz 2026-04-12 3/150 2026-04-17 19:10 by 阳阳阳^_^
[考研] 295分求调剂 +5 ?要上岸? 2026-04-17 5/250 2026-04-17 16:51 by fenglj492
[考研] 恳请有学校收留 +8 柯淮然 2026-04-12 8/400 2026-04-17 09:34 by 猪会飞
[考研] 一志愿沪9,生物学326求调剂 +9 刘墨墨 2026-04-15 9/450 2026-04-16 17:14 by 崔崔崔cccc
[考研] 297,工科调剂?河南农业大学本科 +14 河南农业大学-能 2026-04-14 14/700 2026-04-16 14:41 by dingyanbo1
[考研] 322求调剂 +8 123安康 2026-04-12 15/750 2026-04-16 11:07 by Espannnnnol
[考研] 求调剂学校 +14 不会吃肉 2026-04-13 16/800 2026-04-15 21:59 by noqvsozv
[考研] 297,工科调剂? +10 河南农业大学-能 2026-04-14 10/500 2026-04-15 21:50 by noqvsozv
[考研] 一志愿A区211,22408 321求调剂 +6 随心所欲☆ 2026-04-15 7/350 2026-04-15 21:45 by lbsjt
[考研] 085801电气专硕272求调剂 +19 电气李 2026-04-13 21/1050 2026-04-15 13:37 by 黑科技矿业
[考研] 297工科调剂? +14 河南农业大学-能 2026-04-13 15/750 2026-04-15 13:25 by 黑科技矿业
[教师之家] 转长聘了 +7 简单化xn 2026-04-13 7/350 2026-04-14 14:50 by xindong
[考研] 求调剂 +12 何气正 2026-04-13 13/650 2026-04-14 14:47 by zs92450
[考研] 105500药学求调剂 +4 x_skys 2026-04-12 4/200 2026-04-14 13:37 by rndfc
[考研] 085408光电信息工程专硕355一志愿长春光机所调剂 +6 王ymaa 2026-04-13 13/650 2026-04-14 11:33 by 王ymaa
[考研] 一志愿085802 323分求调剂 +13 drizzle_9 2026-04-12 14/700 2026-04-13 10:26 by Faiz5552
[考研] 346分,工科0854求调剂,专硕 +6 moser233 2026-04-12 7/350 2026-04-12 22:11 by fqwang
信息提示
请填处理意见