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影月beatrice

铁虫 (初入文坛)

[求助] 关于fix shake以及compute命令的应用问题 已有1人参与

我最近写了一个关于超临界水的in文件,里面用到了fix shake命令,但运行的时候一直报错ERROR: Invalid fix style,我对照manuel检查了命令格式,没有发现问题,禁了fix shake后运行又出现ERROR: Invalid compute style,都没查出问题在哪里,请各位大侠不吝赐教,小女子先谢过了
以下是我的in文件
units real
dimension 3
boundary p p p
atom_style full
pair_style lj/charmm/coul/charmm 7.5 8.0 8.0 10.0
bond_style harmonic
angle_style harmonic
read_data data.Mol
angle_coeff 1  55.0000   104.5200
bond_coeff  1  450.0000   0.9572
pair_coeff 1 1 0.1521 3.1507
pair_coeff 1 2 0.0836 1.7753
pair_coeff 2 2 0.0460 0.4000
region 1 block INF INF INF INF INF INF
velocity all create 640 100
velocity all scale 640
#group water type 1 2
fix 1 all shake 0.0001 20 0 b 1 a 1
fix 2 all npt temp 640 760 1000 iso 236.92 236.92 1000 drag 1
timestep 0.01
compute 1 all ke
compute 2 all pe
compute 3 all temp
compute 4 all dilatation/atom
compute 5 all displace/atom
thermo 500
thermo_style custom temp press density vol pe ke etotal enthalpy
run 1000

data文件如下
LAMMPS data file from msi2lmp v3.8 for Mol

      6 atoms
      4 bonds
      2 angles
      0 dihedrals
      0 impropers

   2 atom types
   1 bond types
   1 angle types

    -0.854007846     3.056692154 xlo xhi
    -0.764937233     3.145762767 ylo yhi
    -1.347689527     2.563010473 zlo zhi

Masses

   1  15.999400
   2   1.007970

Atoms

      1      1   1 -0.798200     0.121798883     0.387575451     0.043193656   0   1   0
      2      1   2  0.399100     0.308427222     1.054689176    -0.656528781   0   1   0
      3      1   2  0.399100     0.163119246    -0.433256524    -0.481969457   0   1   0
      4      2   1 -0.798200     1.973583684     2.001768480     1.988670964   0  -1   0
      5      2   2  0.399100     2.453643042     1.441265665     1.343893247   0  -1   0
      6      2   2  0.399100     1.587480847     2.690434354     1.408703210   0  -1   0

Bonds

     1   1      1      2
     2   1      1      3
     3   1      4      5
     4   1      4      6

Angles

     1   1      2      1      3
     2   1      5      4      6
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dgwfly

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yuexiaoming at 2014-08-28 17:10:53
fix shake 所需要的rigid panckage 出问题了

我也遇到类似的问题了,但已安装rigid package,可还是显示unknown fix shake style

发自小木虫IOS客户端
3楼2017-07-12 01:42:23
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查看全部 4 个回答

yuexiaoming

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

fix shake 所需要的rigid panckage 出问题了
2楼2014-08-28 17:10:53
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哦买噶等

新虫 (小有名气)

楼主解决这个问题了吗?求指点啊

发自小木虫IOS客户端
4楼2019-09-08 10:22:44
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