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gong_107

金虫 (小有名气)

[交流] 如何实现该文献中TiO2(101)纳米管的建模

如何实现该文献中TiO2纳米管的建模

请问下大家,如何实现该文献中的TiO2(101)纳米管的建模
第一步: 容易理解,切割出TiO2(101)晶面,得到如图1结构

第二步: 文献原文为“将该面roll,形成single-wall 纳米管”,如图2. 不明白这个roll操作是如何实现的呢? 哪位高人指导,希望能点化几句!

另外,文中明确已经提到,所有操作均在Materials Studio 中完成。

如何实现该文献中TiO2(101)纳米管的建模
1.jpg


如何实现该文献中TiO2(101)纳米管的建模-1
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xiaoboy185

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-05-12 22:26:30
可以参看virtual nanolab的一个例子
2楼2014-04-25 20:07:51
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-05-12 22:26:37
roll就是沿着一个方向卷曲,而这个方向是通过手性矢量来确定。
3楼2014-04-25 22:24:30
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wuli8

荣誉版主 (知名作家)

…………

优秀版主优秀版主


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请把文献信息发上来。
…………
4楼2014-04-26 08:39:52
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gong_107

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wuli8 at 2014-04-26 09:39:52
请把文献信息发上来。

Weihu Yan, Jiajia Fang, Peng Liu, Junfeng Li, Kaiyong Cai.

Theoretical study of the permeation of water through
TiO2 nanotubes using molecular dynamics simulation.  

Molecular Physics. Vol. 109, No. 6, 20 March 2011, 969–974

在该文中的方法部分,作者在对如何架构模型的阐述原文是:
Based on this structure, we can construct the TiO2 nanotube in a
standard way by rolling the molecular monolayer into a cylinder like a graphene sheet to form a carbon nanotube. As in the case of single-walled carbon nanotubes, three groups of TiO2 nanotubes can be designed depending on the rolling direction.

可是并没有提到别的细节,真的不知道他是怎么就实现图中的结构的,特别是说 构架(m,n)(m,0)等结构的纳米管时,不知道他怎么能控制m,n这两个选项的。网上也有其他的帖子说是 先构架C纳米管的结构,直接用MS中的build-singlewall 按钮实现,然后在将所有原子替换?可总觉得不对,那O怎么办呢? 请高人指导!
5楼2014-05-01 19:48:53
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gong_107

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-25 23:24:30
roll就是沿着一个方向卷曲,而这个方向是通过手性矢量来确定。

请问在materials studio中如何实现这个roll 的操作啊? 一直被这个困扰
6楼2014-05-01 19:50:52
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gong_107

金虫 (小有名气)

求指点
7楼2014-05-03 20:45:36
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gong_107

金虫 (小有名气)

自己顶
8楼2014-05-08 20:44:21
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Joannaouc

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gong_107: 金币+5 2014-05-10 11:14:03
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-05-12 22:26:55
MS中没有现成的roll选项,你可以自己编程写。或者我想到一个笨办法,可以手动roll一下然后relax这个结构,不知道能不能行。
9楼2014-05-09 11:21:43
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小雨雪

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by gong_107 at 2014-05-03 20:45:36
求指点

我有与您同样的困惑,我尝试过手动成键制成粗糙的纳米管。但与其他文献中的ROLL出的结果不同 请问您解决了这个问题么?能否就此进行交流?
10楼2015-09-23 20:14:58
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