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fzhrobin

木虫 (正式写手)

[交流] 关于土壤生物多样性检测的问题已有5人参与

想看下不同处理土壤中的微生物群落的多样性变化,现在都有哪些技术可用的?除了DGGE和高通量测序。
以前做过DGGE,但现在有人说过时了,不知道现在行情怎么样?
也不知道DGGE的文章能发表在什么水平的杂志上?
还有,高通量测序似乎很贵,是不是这个就可以发档次比较高的文章呢?
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quiller2000

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
10楼: Originally posted by fzhrobin at 2014-04-29 09:08:31
请问ARISA哪个公司可以做?费用多少?
如果想做土壤中微生物菌群多样性变化,用ARISA好还是DGGE更好?那个目前更流行?公认性更强?主要是发文章方面

谢谢...

没有那个公司做,不过我们实验室做!

两种方法都可以,都发不了什么好文章除非你的材料很好或者有很好的设计。两个方法都是主流方法,ARISA分辨率高,DGGE其实更适合做微生物功能基因的多样性!
致良知
12楼2014-04-29 20:16:16
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nanjizhou91

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主做的DGGE能鉴定到细菌的种吗?另外,听一位师兄说,高通量只能鉴定到属,我也要做DGGE,来交流交流
期望与虫虫们交流学术问题
2楼2014-04-22 18:36:14
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fzhrobin

木虫 (正式写手)

DGGE需要跑完胶切胶回收的,然后克隆测序,得到的片段只有两三百bp,想用这个鉴定到种,难
3楼2014-04-23 10:15:49
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J_iee

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
木虫/panda: 金币+2, 感谢交流,欢迎常来农林版~ 2014-04-24 21:18:54
还有PLFA,就一个色谱然后鉴定,年代也久,但也可以发高水平文章。做了高通量还要看你怎么分析结果,才能发好点的文章。至于DGGE,个人觉得也挺好的,就是条件摸索起来麻烦点
4楼2014-04-24 11:22:32
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