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yurivivi

新虫 (小有名气)

[求助] ts找到过渡态,可以把做irc两端的点提出来优化作为反应物和产物的稳定结构么?已有2人参与

已知反应物和产物的结构,用的是ts的办法找到的过渡态,然后做irc各做了40个点,发现确实往反应物和产物的方向跑了。所以停掉,用各自的最后一个点拿出来再优化,得到了反应物和产物的结构。但是这个结构和我之前单独优化的结构构型是有差别的,角度啊,二面角什么的。请问各位前辈可以用irc的结果这么找反应物和产物么?
ps:算的双分子反应,所以是把A+B放在作为一个输入文件优化的,上面用irc的点优化走出来的构型和之前单独优化的构型不一样。(这个构型主要指两个分子的相对空间位置不一样,A分子和B分子的构型都是没差别的。)还有一个问题:用不同的方法和不同的基组,优化出来的A+B的构型也不一样,这个是正常的么?
希望各位前辈给予指点,完全的新手,也没人指导,都是自己瞎琢磨的。
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yypcnbe

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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yurivivi: 金币+2, 有帮助 2014-04-23 10:41:19
那个两个分子的相对空间位置不一样,你是不是指的是互为镜像结构,可以在gview里面转换镜像
3楼2014-04-20 17:39:38
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