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80003066

金虫 (正式写手)

[求助] 知道蛋白质的氨基酸顺序,如何预测其是否含有锌指结构? 已有3人参与

我现在知道两个蛋白质的氨基酸序列,如何预测其是否含有锌指结构?请帮忙,最好能提供软件的网址,及提交方法。感谢了!!!
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80003066

金虫 (正式写手)

能在具体些吗?刚刚接触这方面知识,谢了!
2楼2014-04-17 10:49:38
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用pfam分析结构域

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-04-17 11:14:38
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80003066

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Neo2000 at 2014-04-17 11:14:38
用pfam分析结构域

预测完 结构域也不能说明什么问题吧
4楼2014-04-17 12:24:25
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exon2002

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

生物信息学预测蛋白质分子结构;功能分子生物学验证结构的功能效应。
5楼2014-04-21 06:26:30
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
80003066: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 感谢了 2014-05-07 10:39:34
自己搜一下zinc finger prediction,大把
比如http://web.iitd.ac.in/~sundar/zifpredict/zifpred_home.html
6楼2014-04-22 05:04:06
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suanweiji

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by wizardfan at 2014-04-22 05:04:06
自己搜一下zinc finger prediction,大把
比如http://web.iitd.ac.in/~sundar/zifpredict/zifpred_home.html

请问预测结果怎么解释啊
7楼2014-04-28 17:48:41
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SuperAA

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by suanweiji at 2014-04-28 17:48:41
请问预测结果怎么解释啊...

为什么要求DNA序列而不是氨基酸序列呢?
8楼2015-08-05 21:48:12
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SuperAA

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by wizardfan at 2014-04-22 05:04:06
自己搜一下zinc finger prediction,大把
比如http://web.iitd.ac.in/~sundar/zifpredict/zifpred_home.html

我现在有氨基酸序列含有两个锌指结构(C4和C3H),其中我想把C4突变为C2H2,但实验结果好像提示没有形成C2H2的锌指结构,可能突变影响了C3H的结构。我不知道能否用计算模拟可以预测??谢谢大家的解答或能否告诉我国内哪位专家研究锌指蛋白??谢谢~
9楼2015-08-05 21:49:42
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