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cassiett90

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问在大肠杆菌中表达蛋白时会不会只表达一段目的蛋白?怎么解决呢?求高人指点 已有5人参与

我最近一直在试着用大肠杆菌表达一个116个氨基酸的蛋白,前面加了个132个氨基酸的sumo标签,再前面是his标签,放在pET28a中表达,目的蛋白总长度为27.6kD,但跑胶却总是只能得到20kD的主条带,质谱显示只有sumo和那116个里面的前面一截目的蛋白,后面的都对不上,但基因测序没有一点问题,这可能是为什么呢?蛋白表达到一半自己停下了??去表达其他的了??怎么会这样呢。。求高人指教啊!!!小女子感激不尽!!!
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woolley

新虫 (初入文坛)

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能详细解释下:
”目的蛋白总长度为27.6kD,但跑胶却总是只能得到20kD的主条带,质谱显示只有sumo和那116个里面的前面一截目的蛋白,后面的都对不上“
蛋白在SDS-PAGE上显示比实际要小是常见的现象
你进行质朴测序了吗,怎么知道后面的都对不上?
如果有部分测序的结果,那么分析起来就好很多,移码突变的话,一个方向就三种可能,一种是你的正确序列,还有两种是突变序列,你看看你质谱出来的序列是不是和突变序列一致,如果一致的话就是移码突变,那么,就去看是在哪个位置开始的移码,然后用同义密码子替换啥的,看看有没有效果。
11楼2014-04-14 11:50:39
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resurgam

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
重新抽质粒,其中10ul重新送测序,双向测通,再分析。如果没有问题,就拿同一管质粒再做转化看看表达。看样子好像是发生了移码突变了。
2楼2014-04-13 11:11:01
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by resurgam at 2014-04-13 11:11:01
重新抽质粒,其中10ul重新送测序,双向测通,再分析。如果没有问题,就拿同一管质粒再做转化看看表达。看样子好像是发生了移码突变了。

有可能载体构建过程中出问题了

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-04-13 12:47:38
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
有可能蛋白翻译出来后被降解掉了,或者是碰到稀有密码子、终止密码子什么的翻译中断了。
4楼2014-04-13 16:32:21
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