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zhanghuayi

金虫 (正式写手)

[求助] 完成度太低 还有问题需要解决已有3人参与


此晶体解析后,checkcif出现如下的问题,求支招?多谢

完成度太低 还有问题需要解决
解晶体的问题.png
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xja1830

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-04-09 16:45:02
多谢,很有用!

再请问一下,解好后,cif里面如下的两行max、min值不为零怎么处理呀!
_refine_ls_shift/su_max           6.051
_refine_ls_shift/su_mean          0.022

最大飘移值>6,已经很大了,平均飘移值0.02,也很大。精修不够收敛。建议将res里建议权重复制代替ins里权重,再继续精修直到最大飘移值《0.1,平均飘移值趋近0.
以一颗执着不变的心,勇往直前,迎向未来。
6楼2014-04-09 19:03:38
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-04-09 21:50:34

这个权重是 WGHT    0.100000  OR
FVAR       0.1224?
但是我试过改任何一个之后上面的两行数值都没减小呀。
改了L.S. 之后也没有解决问题。求支招啊。...

WGHT是权重值,0.1就说明你没有进行权重的精修,你应该将res文件中下方的权重值复制,然后将上方的权重值覆盖,保存后copy到ins文件,然后精修,为了尽快收敛,你可以增加精修的轮数,即将L.S.后的数增大,比如15,如上处理就可以了。
8楼2014-04-09 22:12:42
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普通回帖

xja1830

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
lijunjie84: 金币+1, 感谢参与! 2014-04-09 14:55:54
A问题很好解决,打开cif和ins,把ins里空间群类型,如p21/c 填到相应栏代替问号就行。alert_3_B在ins里加入OMIT -2 50 或者shel 999 0.84再xl精修一下基本能解决。alert_1_B把lst文件里计算分子量填到cif就行。201_alert_1_B有原子各向同性,如果是必需的,说明下应该可以。306_alert_1_B有两个孤立氧原子,说明有还没有完全解析出来,是不是水分子没加氢?建议仔细找原因,再继续精修。
以一颗执着不变的心,勇往直前,迎向未来。
2楼2014-04-09 10:15:50
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xja1830

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

是三个孤立氧原子。完成度低跟衍射数据质量和解析完整度有关。建议仔细寻找原因。
以一颗执着不变的心,勇往直前,迎向未来。
3楼2014-04-09 10:20:28
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
lijunjie84: 金币+1, 专家考核, 感谢参与! 2014-04-09 14:55:46
引用回帖:
2楼: Originally posted by xja1830 at 2014-04-09 10:15:50
A问题很好解决,打开cif和ins,把ins里空间群类型,如p21/c 填到相应栏代替问号就行。alert_3_B在ins里加入OMIT -2 50 或者shel 999 0.84再xl精修一下基本能解决。alert_1_B把lst文件里计算分子量填到cif就行。201_ ...

补充一点,分子量计算时要注意Z值,在Z值正确的前提下,用lst里的原子个数代替res文件中相应原子的个数,精修后自然就不会再出现这个问题了。
4楼2014-04-09 10:55:41
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)

多谢,很有用!

再请问一下,解好后,cif里面如下的两行max、min值不为零怎么处理呀!
_refine_ls_shift/su_max           6.051
_refine_ls_shift/su_mean          0.022
没有捷径,只有经营
5楼2014-04-09 16:45:02
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by xja1830 at 2014-04-09 19:03:38
最大飘移值>6,已经很大了,平均飘移值0.02,也很大。精修不够收敛。建议将res里建议权重复制代替ins里权重,再继续精修直到最大飘移值《0.1,平均飘移值趋近0....


这个权重是 WGHT    0.100000  OR
FVAR       0.1224?
但是我试过改任何一个之后上面的两行数值都没减小呀。
改了L.S. 之后也没有解决问题。求支招啊。
没有捷径,只有经营
7楼2014-04-09 21:50:34
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forever1706

禁虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
有两个非氢原子未做各项异性是为啥,是游离的水吗? 精修不收敛,可能有原子定的不合理,或者无序没做好?
9楼2014-04-10 04:37:45
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)

都没有效果,一样的mean max值不变小。求解啊
没有捷径,只有经营
10楼2014-04-13 15:42:16
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