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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 完成度太低 还有问题需要解决
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)

[求助] 完成度太低 还有问题需要解决 已有3人参与


此晶体解析后，checkcif出现如下的问题，求支招？多谢

完成度太低 还有问题需要解决
解晶体的问题.png
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没有捷径，只有经营
1楼 2014-04-09 09:47:39
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

xja1830

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-04-09 16:45:02
多谢，很有用！

再请问一下，解好后，cif里面如下的两行max、min值不为零怎么处理呀！
_refine_ls_shift/su_max           6.051
_refine_ls_shift/su_mean          0.022

最大飘移值>6,已经很大了，平均飘移值0.02，也很大。精修不够收敛。建议将res里建议权重复制代替ins里权重，再继续精修直到最大飘移值《0.1，平均飘移值趋近0.
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以一颗执着不变的心，勇往直前，迎向未来。
6楼2014-04-09 19:03:38
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-04-09 21:50:34

这个权重是 WGHT    0.100000  OR
FVAR       0.1224？
但是我试过改任何一个之后上面的两行数值都没减小呀。
改了L.S. 之后也没有解决问题。求支招啊。...

WGHT是权重值，0.1就说明你没有进行权重的精修，你应该将res文件中下方的权重值复制，然后将上方的权重值覆盖，保存后copy到ins文件，然后精修，为了尽快收敛，你可以增加精修的轮数，即将L.S.后的数增大，比如15，如上处理就可以了。
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8楼2014-04-09 22:12:42
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普通回帖

xja1830

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
lijunjie84: 金币+1, 感谢参与！ 2014-04-09 14:55:54
A问题很好解决，打开cif和ins，把ins里空间群类型，如p21/c 填到相应栏代替问号就行。alert_3_B在ins里加入OMIT -2 50 或者shel 999 0.84再xl精修一下基本能解决。alert_1_B把lst文件里计算分子量填到cif就行。201_alert_1_B有原子各向同性，如果是必需的，说明下应该可以。306_alert_1_B有两个孤立氧原子，说明有还没有完全解析出来，是不是水分子没加氢？建议仔细找原因，再继续精修。
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2楼2014-04-09 10:15:50
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xja1830

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

是三个孤立氧原子。完成度低跟衍射数据质量和解析完整度有关。建议仔细寻找原因。
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3楼2014-04-09 10:20:28
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
lijunjie84: 金币+1, 专家考核, 感谢参与！ 2014-04-09 14:55:46
引用回帖:
2楼: Originally posted by xja1830 at 2014-04-09 10:15:50
A问题很好解决，打开cif和ins，把ins里空间群类型，如p21/c 填到相应栏代替问号就行。alert_3_B在ins里加入OMIT -2 50 或者shel 999 0.84再xl精修一下基本能解决。alert_1_B把lst文件里计算分子量填到cif就行。201_ ...

补充一点，分子量计算时要注意Z值，在Z值正确的前提下，用lst里的原子个数代替res文件中相应原子的个数，精修后自然就不会再出现这个问题了。
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4楼2014-04-09 10:55:41
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)
多谢，很有用！

再请问一下，解好后，cif里面如下的两行max、min值不为零怎么处理呀！
_refine_ls_shift/su_max           6.051
_refine_ls_shift/su_mean          0.022
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没有捷径，只有经营
5楼2014-04-09 16:45:02
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by xja1830 at 2014-04-09 19:03:38
最大飘移值>6,已经很大了，平均飘移值0.02，也很大。精修不够收敛。建议将res里建议权重复制代替ins里权重，再继续精修直到最大飘移值《0.1，平均飘移值趋近0....


这个权重是 WGHT    0.100000  OR
FVAR       0.1224？
但是我试过改任何一个之后上面的两行数值都没减小呀。
改了L.S. 之后也没有解决问题。求支招啊。
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没有捷径，只有经营
7楼2014-04-09 21:50:34
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forever1706

禁虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
有两个非氢原子未做各项异性是为啥，是游离的水吗？ 精修不收敛，可能有原子定的不合理，或者无序没做好？
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9楼2014-04-10 04:37:45
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)
都没有效果，一样的mean max值不变小。求解啊
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没有捷径，只有经营
10楼2014-04-13 15:42:16
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