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dreamsail

银虫 (正式写手)

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[交流] 求助!!关于16S rRNA鉴定细菌的问题已有2人参与

株实验菌的16S rRNA测序结果在GenBank上比对,相似度最高的只有98%左右,能否鉴定为统一菌种?
谢谢!

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1楼 2008-02-29 01:53:18

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yyw30000

铜虫 (小有名气)

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这种情况很可能是个新种，继续努力朝下做吧

6楼2011-03-23 17:54:47

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puma2003

铁杆木虫 (著名写手)

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完全可以

不过一般还要结合生理生化性状的测定如硝酸盐还原、柠檬酸盐试验等

[ Last edited by puma2003 on 2008-2-29 at 08:27 ]

2楼2008-02-29 08:23:41

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zhjcao

木虫 (小有名气)

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专业: 环境微生物学

很难说，至少要做个进化树，另外，与你98%同源性基因性质有关，这个种是确定的模式种还是也是比对来的，就决定了你的结果的可靠性。
有条件的话，最好做一些生理生化实验，特别是该种的特征实验。

3楼2008-02-29 08:51:50

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wangjun0457

银虫 (小有名气)

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专业: 生物化学

同一楼上两位虫友的看法

4楼2008-02-29 10:55:52

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