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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 求助!!关于16S rRNA鉴定细菌的问题
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dreamsail

银虫 (正式写手)

[交流] 求助!!关于16S rRNA鉴定细菌的问题 已有2人参与

株实验菌的16S rRNA测序结果在GenBank上比对,相似度最高的只有98%左右,能否鉴定为统一菌种?
谢谢!
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1楼 2008-02-29 01:53:18
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zhjcao

木虫 (小有名气)
很难说，至少要做个进化树，另外，与你98%同源性基因性质有关，这个种是确定的模式种还是也是比对来的，就决定了你的结果的可靠性。
有条件的话，最好做一些生理生化实验，特别是该种的特征实验。
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3楼2008-02-29 08:51:50
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puma2003

铁杆木虫 (著名写手)
完全可以 不过一般还要结合生理生化性状的测定如硝酸盐还原、柠檬酸盐试验等

[ Last edited by puma2003 on 2008-2-29 at 08:27 ]
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2楼2008-02-29 08:23:41
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wangjun0457

银虫 (小有名气)
同一楼上两位虫友的看法
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4楼2008-02-29 10:55:52
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飞翔珊瑚海

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
得做生理生化实验，如果要精确确定，还得用已知DNA做分子杂交
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5楼2011-03-23 15:42:19
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