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求助!!关于16S rRNA鉴定细菌的问题
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dreamsail
银虫
(正式写手)
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专业: 微生物
[交流]
求助!!关于16S rRNA鉴定细菌的问题
已有2人参与
株实验菌的16S rRNA测序结果在GenBank上比对,相似度最高的只有98%左右,能否鉴定为统一菌种?
谢谢!
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1楼
2008-02-29 01:53:18
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wangjun0457
银虫
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虫号: 511865
注册: 2008-02-26
专业: 生物化学
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4楼
2008-02-29 10:55:52
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puma2003
铁杆木虫
(著名写手)
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帖子: 2798
在线: 757.5小时
虫号: 424442
注册: 2007-07-22
性别: GG
专业: 临床生物化学检验
完全可以
不过一般还要结合生理生化性状的测定如硝酸盐还原、柠檬酸盐试验等
[
Last edited by puma2003 on 2008-2-29 at 08:27
]
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2楼
2008-02-29 08:23:41
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zhjcao
木虫
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帖子: 164
在线: 311.9小时
虫号: 48639
注册: 2004-06-26
专业: 环境微生物学
很难说,至少要做个进化树,另外,与你98%同源性基因性质有关,这个种是确定的模式种还是也是比对来的,就决定了你的结果的可靠性。
有条件的话,最好做一些生理生化实验,特别是该种的特征实验。
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3楼
2008-02-29 08:51:50
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飞翔珊瑚海
新虫
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虫号: 1101003
注册: 2010-09-16
性别:
MM
专业: 环境微生物学
★
小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
得做生理生化实验,如果要精确确定,还得用已知DNA做分子杂交
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5楼
2011-03-23 15:42:19
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