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葵cc_

木虫 (小有名气)

[求助] 表面体系的结构优化 已有3人参与

各位前辈,本人刚接触VASP,现在想用它来计算表面体系,ENCUT、K-mesh、SIGMA都优化好了,接下来想进行结构优化。
       看了侯老师的教程,关于表面体系的结构优化这一块,候老师写到“在对表面体系的结构进行优化时,主要是对原子的位置进行优化,而不再对原胞(Slab模型得到的)大小进行优化,一般采用的是Selective Dynamics(也就是有选择性的位置弛豫)。”
       我计算的体系是2x2x3的超胞,对照侯老师的教程进行了Selective Dynamics,计算结果出现ZBRENT: fatal error in bracketing please rerun with smaller EDIFF, or copy CONTCAR to POSCAR and continue,重新设置之后也没有什么效果。
       问题:
(1)表面体系的结构优化具体是怎么做的?有经验的前辈能分享一下你们的例子吗?包括具体的步骤和设置,不胜感激~~~~
(2)不需要优化晶格常数,而需要优化原子位置又是为什么?
(3)像以上的Selective Dynamics有选择性的位置弛豫,又是怎么判断该体系的原子已经弛豫到了最佳位置。

谢谢~~~
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

1.做表面先优化原包,在原包的基础上做出表面,固定底层原子,优化表面原子

2.表面没有办法去优化相应的晶格常数了,也没有意义。
3楼2014-04-24 23:59:39
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
5楼: Originally posted by sungjen at 2014-04-25 09:26:52
我最近遇到一个问题,在优化完的晶胞基础上,切出来的和未优化的切出来的不一样  不知道该怎么处理。看了你这个回复,难道是要优化primitive cell 然后在此基础上建造?那么这个晶格常数是再需要单独优化得到吗?如 ...

你肯定要先优化单胞,优化好了就有了晶格常数,在这个基础切出来。这你已经用了晶格常数了。切出来是二维面了,这个时候的K点就是KK1形式。K点你可以自己测试一下,其余的参数和单胞计算一致就行。
6楼2014-04-25 09:33:22
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
7楼: Originally posted by sungjen at 2014-04-25 09:44:04
额,多谢。我遇到一个奇怪问题是我用优化好的切出来的面和未优化切出来的不一样 ,面心立方的金属,只是改变晶格常数。为什么切出来都不一样呢 ?我在 文献上看到的别人晶格常数跟我一样,不知道slab模型是怎么建造 ...

单胞,超包都可以。看你自己想怎样。结果都是一样,单胞切了想做大就再超包,做了超包再切免去后面做超包。我看来没区别。
至于你为什么切出来不对,说实在的这不太可能。你仔细看清楚后,再想想。
再则你是自己写程序切的还是用软件,比如MS或者VESTA。这些手段可以互相验证一下。
8楼2014-04-25 10:04:51
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
9楼: Originally posted by sungjen at 2014-04-25 10:15:04
我使用MS  两个的设置都一样,只是初始的晶格常数不一样 ,结果切出来的原子数都不一样  这是我最奇怪地...

晶格常数的变化不会影响你切表面的情况,那样也只是改变表面的晶格常数而已。
10楼2014-04-25 10:44:59
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
11楼: Originally posted by sungjen at 2014-04-25 11:11:23
额,但是为什么切出来不一样呢?还有就是构件表面是优化原胞构建还是晶胞构建  ?这样晶格常数就优化不出来了 ,就算单独优化出来也没有用上啊...

前面我已经说过了,怎么切结果都是一样的。最后表面结构还是需要优化。
前面优化单胞只是为了获得合理的晶格常数而已。

问题已经回答的很清楚了,你自己考虑一下。
12楼2014-04-25 12:02:25
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