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我做氨基酸结构优化，关键词设置为：
#P cam-b3lyp/aug-cc-pvdz Maxdisk=20GB opt=(Z-matrix, maxcycle=200) freq=raman
scf=(direct, tight) scfcyc=300 nosymm
出现这样的错误：
Error termination via Lnk1e in /public/software/g09/l716.exe at Thu Apr 3 18:36:56 2014.
请问，有谁知道这样的错误怎么改正吗？

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我喜欢收集微笑没有原因……

1楼 2014-04-03 20:38:46

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枪下游魂

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★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
ddwy: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-04-08 08:54:58
gmy1990: 金币+1 2014-04-09 05:13:05

Error on Z-matrix card number 18
angle Alpha is outside the valid range of 0 to 180.

这是错误原因，这一步的结构貌似有问题，所以
Conversion from Z-matrix to cartesian coordinates failed

建议你排查一下结构，或者用笛卡尔坐标

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4楼2014-04-04 09:18:34

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beefly

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★ ★
gmy1990: 金币+2 2014-04-09 05:13:13

原子18的键角>180，这是不允许的。如果180对应高对称结构，就把这个角度固定在180，不能优化。

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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地

5楼2014-04-04 09:28:11

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枪下游魂

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2楼2014-04-04 08:13:29

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ddwy

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2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-04-04 08:13:29
把输出文件最后10行的都贴出来

Cartesian Forces:  Max    0.033266811 RMS    0.010627159
Error on Z-matrix card number 18
angle Alpha is outside the valid range of 0 to 180.
Conversion from Z-matrix to cartesian coordinates failed:
---------------------------------------------------------------------------------------------------
                        Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES)
CD Cent Atom N1    Length/X       N2    Alpha/Y       N3       Beta/Z       J
---------------------------------------------------------------------------------------------------
   1    1  N
   2    2  H       1 0.999900(    1)
   3    3  H       1 0.999900(    2)    2  113.327( 26)
   4    4  H       1 1.000000(    3)    2  103.184( 27)    3  243.699( 50)    0
   5    5  C       1 1.507074(    4)    2  102.023( 28)    3  124.654( 51)    0
   6    6  H       5 1.092731(    5)    1  111.792( 29)    3  296.095( 52)    0
   7    7  C       5 1.520063(    6)    1  108.549( 30)    3  418.020( 53)    0
   8    8  H       7 1.099728(    7)    5  111.981( 31)    6 59.228( 54)    0
   9    9  H       7 1.096234(    8)    5  110.280( 32)    6  181.228( 55)    0
   10    10  H       7 1.095524(    9)    5  109.302( 33)    6  300.028( 56)    0
   11    11  C       5 1.550679( 10)    1  103.581( 34)    3  175.757( 57)    0
   12    12  O    11 1.268267( 11)    5  109.983( 35)    6  196.169( 58)    0
   13    13  O    11 1.241479( 12)    5  120.681( 36)    6 24.606( 59)    0
   14    14  N    13 2.994519( 13)    11 73.437( 37)    12 69.560( 60)    0
   15    15  H    14 0.999900( 14)    13 81.014( 38)    11 39.965( 61)    0
   16    16  H    14 1.000000( 15)    13 67.355( 39)    11  288.730( 62)    0
   17    17  H    14 0.999900( 16)    13 60.723( 40)    11  163.040( 63)    0
   18    18  C    14 1.497252( 17)    13  180.139( 41)    11  201.204( 64)    0
   19    19  H    18 1.097137( 18)    14  106.727( 42)    15 80.427( 65)    0
   20    20  C    18 1.510911( 19)    14  113.920( 43)    15  204.013( 66)    0
   21    21  H    20 1.097850( 20)    18  111.975( 44)    19 60.275( 67)    0
   22    22  H    20 1.097859( 21)    18  110.844( 45)    19  182.139( 68)    0
   23    23  H    20 1.093161( 22)    18  108.174( 46)    19  299.782( 69)    0
   24    24  C    18 1.572212( 23)    14  102.983( 47)    15  329.640( 70)    0
   25    25  O    24 1.281244( 24)    18  113.300( 48)    19  270.491( 71)    0
   26    26  O    24 1.217731( 25)    18  117.612( 49)    19 88.389( 72)    0
---------------------------------------------------------------------------------------------------
Error termination via Lnk1e in /public/software/g09/l716.exe at Thu Apr  3 18:36:56 2014.
Job cpu time:  3 days 11 hours 28 minutes 41.8 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF= 102 Int=    0 D2E=    0 Chk=    9 Scr=    1
谢谢你，上面是最后几行的信息，这些内容上面几行是关于Forces (Hartrees/Bohr)的信息

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3楼2014-04-04 08:50:26

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4楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-04-04 09:18:34
Error on Z-matrix card number 18
angle Alpha is outside the valid range of 0 to 180.

这是错误原因，这一步的结构貌似有问题，所以
Conversion from Z-matrix to cartesian coordinates failed

建议 ...

谢谢了

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6楼2014-04-08 08:53:14

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5楼: Originally posted by beefly at 2014-04-04 09:28:11
原子18的键角>180，这是不允许的。如果180对应高对称结构，就把这个角度固定在180，不能优化。

谢谢

我还想问一下，我能不能用内坐标的形式把氨基酸的键长都进行冻结，只研究两分子氨基酸之间的相互作用？这样做有意义吗？

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7楼2014-04-08 08:54:42

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6楼: Originally posted by ddwy at 2014-04-08 08:53:14
谢谢了

...

我还想问一下，我能不能用内坐标的形式把氨基酸的键长都进行冻结，只研究两分子氨基酸之间的相互作用？这样做有意义吗？

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8楼2014-04-08 08:55:50

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引用回帖:

你好，我重新冻结了所有分子的分子内键长，还是用内坐标，同样的设置关键词，但是结果还是出错

Cartesian Forces:  Max    0.143807193 RMS    0.033409470
Error on Z-matrix card number 17
angle Alpha is outside the valid range of 0 to 180.
Conversion from Z-matrix to cartesian coordinates failed:
---------------------------------------------------------------------------------------------------
                        Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES)
CD Cent Atom N1    Length/X       N2    Alpha/Y       N3       Beta/Z       J
---------------------------------------------------------------------------------------------------
   1    1  N
   2    2  H       1 0.999900(    1)
   3    3  H       1 0.999900(    2)    2  108.084( 26)
   4    4  H       1 1.000000(    3)    2  104.961( 27)    3  236.884( 50)    0
   5    5  C       1 1.469900(    4)    2  100.157( 28)    3  120.151( 51)    0
   6    6  H       5 1.069900(    5)    1  108.454( 29)    3  262.084( 52)    0
   7    7  C       5 1.540000(    6)    1  111.062( 30)    3  387.079( 53)    0
   8    8  H       7 1.069900(    7)    5  110.961( 31)    6 57.514( 54)    0
   9    9  H       7 1.070000(    8)    5  110.775( 32)    6  179.754( 55)    0
   10    10  H       7 1.069900(    9)    5  107.936( 33)    6  298.455( 56)    0
   11    11  C       5 1.539900( 10)    1  100.120( 34)    3  149.834( 57)    0
   12    12  O    11 1.258400( 11)    5  115.639( 35)    6  218.923( 58)    0
   13    13  O    11 1.430000( 12)    5  114.994( 36)    6 25.479( 59)    0
   14    14  N    13 2.718108( 13)    11 80.550( 37)    12 57.082( 60)    0
   15    15  H    14 0.999900( 14)    13  100.968( 38)    11 3.887( 61)    0
   16    16  H    14 1.000000( 15)    13  109.723( 39)    11  242.183( 62)    0
   17    17  H    14 0.999900( 16)    13 -0.034( 40)    11  146.130( 63)    0
   18    18  C    14 1.469900( 17)    13  105.823( 41)    11  118.136( 64)    0
   19    19  H    18 1.069900( 18)    14  109.466( 42)    15  139.937( 65)    0
   20    20  C    18 1.540000( 19)    14  112.071( 43)    15  260.340( 66)    0
   21    21  H    20 1.070000( 20)    18  110.743( 44)    19 56.019( 67)    0
   22    22  H    20 1.069900( 21)    18  110.910( 45)    19  177.805( 68)    0
   23    23  H    20 1.070000( 22)    18  107.746( 46)    19  296.586( 69)    0
   24    24  C    18 1.540000( 23)    14  110.431( 47)    15  388.028( 70)    0
   25    25  O    24 1.258400( 24)    18  120.970( 48)    19  226.115( 71)    0
   26    26  O    24 1.429900( 25)    18  112.719( 49)    19 42.156( 72)    0
---------------------------------------------------------------------------------------------------
Error termination via Lnk1e in /public/software/g09/l716.exe at Tue Apr  8 19:26:27 2014.
Job cpu time:  4 days  6 hours 15 minutes 32.9 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF= 102 Int=    0 D2E=    0 Chk=    9 Scr=    1
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9楼2014-04-08 20:52:51

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5楼: Originally posted by beefly at 2014-04-04 09:28:11
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