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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化新手直通车 » 【求助】单点能计算
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hustyh0801

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】单点能计算

我们想重复文献做一个分子的单点能和它的构象的关系，方法和基组与文献一致，先通过opt优化找到最低能量的构像，然后以此构象为基准，选定一个二面角每次旋转10度，其他保持不变，然后计算每一个构象的单点能。但是结果很不一样，如下图所示：前面是我们的计算结果，后面是文献给出的结果。由于刚接触量化计算，所以很多问题不明白，请求高人指教啊！！
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1楼 2010-11-23 14:44:34
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a110119999

铜虫 (正式写手)
人家做的是扫描吧
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2楼2010-11-23 16:03:00
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manson1998

金虫 (著名写手)
你优化完的结构与文献一致么
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3楼2010-11-23 16:27:52
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ykwang

金虫 (正式写手)
你计算的是构型的刚性转动势能曲线而文献的结果则不是刚性转动。换言之，你必须对刚性转动后的每一构型作一次限制性的几何优化才能与文献结果比较。
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4楼2010-11-23 16:47:40
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hustyh0801

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by manson1998 at 2010-11-23 16:27:52:
你优化完的结构与文献一致么

优化完的结构和文献的相比键长，键角以及二面角都是比较接近的，比如说我们最优构象的二面角都是在74度左右，相差很小。另外我们优化的方法和基组也是一样的，按道理来讲所得最优构象也该是一样的吧。
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5楼2010-11-23 17:50:10
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hustyh0801

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ykwang at 2010-11-23 16:47:40:
你计算的是构型的刚性转动势能曲线而文献的结果则不是刚性转动。换言之，你必须对刚性转动后的每一构型作一次限制性的几何优化才能与文献结果比较。

能讲的更明白一些吗？刚刚接触计算，不是很明白。限制性的几何优化会改变分子的哪些参数，而会保留优化前的哪些参数？另外具体该怎么做？请不吝指教！！
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6楼2010-11-23 17:53:28
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ykwang

金虫 (正式写手)
hustyh0801(金币+2): 2010-11-23 18:01:26
引用回帖:
Originally posted by hustyh0801 at 2010-11-23 17:53:28:

能讲的更明白一些吗？刚刚接触计算，不是很明白。限制性的几何优化会改变分子的哪些参数，而会保留优化前的哪些参数？另外具体该怎么做？请不吝指教！！

就是固定那个二面角，只对其他的几何参数进行优化。
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7楼2010-11-23 17:55:32
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hustyh0801

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ykwang at 2010-11-23 17:55:32:

就是固定那个二面角，只对其他的几何参数进行优化。

我明白你的意思了但是我现在还不知道怎么在输入文件中原子坐标栏中做这一限制，如果方便的话能否再次指教！谢谢！
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8楼2010-11-23 18:00:10
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ykwang

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by hustyh0801 at 2010-11-23 18:00:10:

我明白你的意思了但是我现在还不知道怎么在输入文件中原子坐标栏中做这一限制，如果方便的话能否再次指教！谢谢！

这在gaussian手册上已经说的很明白了，你应该自己去查一查。
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9楼2010-11-23 18:03:37
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hustyh0801

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ykwang at 2010-11-23 18:03:37:

这在gaussian手册上已经说的很明白了，你应该自己去查一查。

我已经查过，通过内坐标的方法，定义Variables 量和Constants 量。
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10楼2010-11-23 18:45:50
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15612830511楼
2013-08-07 08:36   回复  
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