24小时热门版块排行榜    

查看: 2407  |  回复: 3

honghaier90

新虫 (小有名气)

[求助] lammps的并行计算出现bond atoms missing 的错误

最近在模拟中遇到这样一个问题:我的模型是将每个粒子用键连接起来,当把我的模型放到主节点上单机运算的时候,一点问题也没有;但是一旦将模型提交到集群里并行运算时候,就会出现bond atoms missing 的错误。请问有没有人遇到类似的问题,能给提供个解决的方法吗?
回复此楼
优秀是一种习惯!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gswylq

木虫 (正式写手)

请问你的问题是如何解决额?我也碰到了这个问题
2楼2015-11-14 12:37:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zl22213665

新虫 (初入文坛)

我也遇到了这个问题 , 有的模型就能多核运算,有的模型就会出现和楼主一模一样的问题,不知道 楼主有什么新发现吗
3楼2017-11-22 21:53:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jluchemlib

铁杆木虫 (正式写手)

把neighbor list的bin size增加一些试试,或者comm_modify cutoff给一个值,如果还是不行,楼主可以检查一下初始构型是否合理
4楼2017-11-23 11:00:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 honghaier90 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 298求调剂 +6 上岸6666@ 2026-03-20 6/300 2026-03-22 20:21 by edmund7
[考研] 310求调剂 +4 baibai1314 2026-03-16 4/200 2026-03-22 20:19 by edmund7
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +11 梨花珞晚风 2026-03-17 11/550 2026-03-22 17:42 by luoyongfeng
[考研] 286求调剂 +10 Faune 2026-03-21 10/500 2026-03-21 23:34 by 314126402
[考研] 313求调剂 +4 肆叁贰壹22 2026-03-19 4/200 2026-03-21 17:33 by ColorlessPI
[考研] 306求0703调剂一志愿华中师范 +5 纸鱼ly 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:11 by 学员8dgXkO
[考研] 083200学硕321分一志愿暨南大学求调剂 +3 innocenceF 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:35 by JourneyLucky
[考研] 华东师范大学-071000生物学-293分-求调剂 +3 研究生何瑶明 2026-03-18 3/150 2026-03-21 01:30 by JourneyLucky
[考研] 295求调剂 +4 一志愿京区211 2026-03-18 6/300 2026-03-20 23:41 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南昌大学,327分,材料与化工085600 +9 Ncdx123456 2026-03-19 9/450 2026-03-20 23:41 by lovewei0727
[考研] 288求调剂 +16 于海海海海 2026-03-19 16/800 2026-03-20 22:28 by JourneyLucky
[考研] 329求调剂 +9 想上学吖吖 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:01 by luoyongfeng
[考研] 材料学硕297已过四六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-03-19 11/550 2026-03-20 21:30 by laoshidan
[考研] 一志愿南理工085701环境302求调剂院校 +3 葵梓卫队 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:28 by zhukairuo
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +7 困于星晨 2026-03-17 9/450 2026-03-20 17:38 by 无懈可击111
[考研] 320求调剂0856 +3 不想起名字112 2026-03-19 3/150 2026-03-19 22:53 by 学员8dgXkO
[考研] 【同济软件】软件(085405)考研求调剂 +3 2026eternal 2026-03-18 3/150 2026-03-18 19:09 by 搏击518
[考研] 085601求调剂 +4 Du.11 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:08 by ruiyingmiao
[考研] 290求调剂 +3 p asserby. 2026-03-15 4/200 2026-03-17 16:35 by wangkm
[考研] 有没有道铁/土木的想调剂南林,给自己招师弟中~ +3 TqlXswl 2026-03-16 7/350 2026-03-17 15:23 by TqlXswl
信息提示
请填处理意见