应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps的并行计算出现bond atoms missing 的错误
41/1返回列表
查看: 2583  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

honghaier90

新虫 (小有名气)

[求助] lammps的并行计算出现bond atoms missing 的错误

最近在模拟中遇到这样一个问题：我的模型是将每个粒子用键连接起来，当把我的模型放到主节点上单机运算的时候，一点问题也没有；但是一旦将模型提交到集群里并行运算时候，就会出现bond atoms missing 的错误。请问有没有人遇到类似的问题，能给提供个解决的方法吗？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
优秀是一种习惯！
1楼 2014-04-03 09:12:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gswylq

木虫 (正式写手)
请问你的问题是如何解决额？我也碰到了这个问题
赞一下 回复此楼
2楼2015-11-14 12:37:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zl22213665

新虫 (初入文坛)
我也遇到了这个问题 ， 有的模型就能多核运算，有的模型就会出现和楼主一模一样的问题，不知道 楼主有什么新发现吗
赞一下 回复此楼
3楼2017-11-22 21:53:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jluchemlib

铁杆木虫 (正式写手)
把neighbor list的bin size增加一些试试，或者comm_modify cutoff给一个值，如果还是不行，楼主可以检查一下初始构型是否合理
赞一下 回复此楼
4楼2017-11-23 11:00:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 honghaier90 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 11/550 2026-10-26 00:47 by cLOojpOxkX0G
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 12/600 2026-10-26 00:45 by cLOojpOxkX0G
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 5/250 2026-10-26 00:19 by cLOojpOxkX0G
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 GVGRDgNfv7P4 2026-10-23 5/250 2026-10-26 00:08 by cLOojpOxkX0G
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 WqtG0Aem8Ufl 2026-10-24 3/150 2026-10-25 20:24 by cLOojpOxkX0G
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 WqtG0Aem8Ufl 2026-10-24 4/200 2026-10-25 20:14 by cLOojpOxkX0G
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 WqtG0Aem8Ufl 2026-10-24 3/150 2026-10-25 20:11 by cLOojpOxkX0G
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 WqtG0Aem8Ufl 2026-10-24 5/250 2026-10-25 20:07 by cLOojpOxkX0G
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 3xN9SualEUPt 2026-10-24 4/200 2026-10-25 14:20 by XiYP04It3Evb
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 3xN9SualEUPt 2026-10-24 4/200 2026-10-25 14:07 by XiYP04It3Evb
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 7xHjyB3bAiwg 2026-10-24 6/300 2026-10-25 13:11 by XiYP04It3Evb
[博后之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 9/450 2026-10-25 13:02 by XiYP04It3Evb
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 11/550 2026-10-25 12:49 by XiYP04It3Evb
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 7xHjyB3bAiwg 2026-10-24 4/200 2026-10-25 01:22 by XcOYG53d3x4p
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 8/400 2026-10-25 00:15 by XcOYG53d3x4p
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 7xHjyB3bAiwg 2026-10-24 3/150 2026-10-24 18:23 by WqtG0Aem8Ufl
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 7xHjyB3bAiwg 2026-10-24 3/150 2026-10-24 15:41 by Equinoxhua
[文学芳草园] 亲密关系 +7 宋昙 2026-10-21 13/650 2026-10-23 17:07 by 小牧11
[考博] 27秋申博自荐 +4 且听风吟时 2026-10-21 4/200 2026-10-23 13:26 by 大大大肥虫
[考博] 郑州大学申博 +5 stars~ 2026-10-19 8/400 2026-10-22 15:06 by stars~
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭