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lihuahan

银虫 (初入文坛)

[求助] 关于原核表达载体构建,跪求~~~~ 已有2人参与

生物新手,有两个问题想求助一下:
1.现在要构建一个原核表达载体,我查的有两种方案,第一种是将目的基因PCR后直接连接到表达载体,再转化到表达菌株中,第二种是把目的基因连接到克隆载体,再酶切后再连接到表达载体,最后再转化到表达菌种,请问第二步中的克隆菌株有必要嘛?哪种方案比较可行?
2.在得到cDNA后,第一种是通过设计引物反转录得到目的基因的DNA,再对它双酶切,第二种是设计两端含有酶切位点的引物并添加保护碱基,再通过反转录直接得到双酶切后的目的基因,哪种比较可行?谢谢~~~~~~~~~~
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lihuahan

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
10楼: Originally posted by biostar2009 at 2014-04-30 10:51:37
你不是已经知道CDS了么?CDS就是你的ORF
我估计你就是在考虑顺框的问题,要是你用的酶切位点不顺框,添加几个碱基让它顺了就行了
纯化蛋白选载体,讲究多了去了。。。
要用什么tag?在哪个宿主表达?用什么表达 ...

查的资料说CDS序列不是ORF呀……

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
11楼2014-05-01 11:08:02
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lihuahan(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励热心回帖交流 2014-04-01 13:29:22
混乱,一篇混乱。
第一个问题
不明白为什么还有个“克隆质粒”?
你要表达某个基因,你就直接把这段基因片段插到你的表达载体就可以了。克隆载体是最基本的载体,可以装片段的载体几乎都可以叫克隆载体,表达载体至少可以说是“可以表达的克隆载体”。
倒是后面一段可能需要点理解,那为什么表达载体要经过“克隆菌”到“表达菌”的过程呢?
一般而言,表达载体都是在克隆菌里面做克隆鉴定的,不建议直接转化表达菌,因为表达载体在表达菌中的情况比较复杂,可能因为泄露表达等原因导致表达菌生长受阻。
第二个问题
这个“反转录"不是这样乱用的
我不太明白你的意思
你所谓的cDNA,就是mRNA做反转录之后的cDNA第一链,
”通过反转录直接得到双酶切后的目的基因“
这到底是什么意思?
2楼2014-04-01 09:18:55
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xiaopeiliang

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-04-01 18:31:09
第一种方法吧,常规的方法,不过克隆载体完全可以不用啊,PCR完后直接酶切连到表达载体上就行,中间的克隆菌株还是要保存下的,因为质粒在克隆菌株中要稳定的多,不会重排/丢失,直接转到表达菌中不太好
3楼2014-04-01 17:30:35
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lihuahan

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by biostar2009 at 2014-04-01 09:18:55
混乱,一篇混乱。
第一个问题
不明白为什么还有个“克隆质粒”?
你要表达某个基因,你就直接把这段基因片段插到你的表达载体就可以了。克隆载体是最基本的载体,可以装片段的载体几乎都可以叫克隆载体,表达载体 ...

1.我看到有的人做的时候是在得到目的基因的DNA后,把DNA插入到pMD中,再对pMD双酶切,然后再对表达载体双酶切,把从pMD双酶切得到的目的片段再插入表达载体。
2.就是再得到cDNA第一链后,设计的引物再反转录PCR后可直接得到带有双酶切位点的目的基因。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2014-04-01 22:39:50
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