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eva_dan

金虫 (小有名气)

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[求助] 用VMD构建DNA分子时如何删除其中部分原子构建一个缺陷？已有1人参与

用VMD构建DNA分子时如何删除其中一个地方的碱基构建一个缺陷？刚刚学习这个软件在说明书里也找不到对应的方法~~~ 求助额感激不尽~~~ 说删除的地方也要加上力场这个怎么加呢？？

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终身学习者

1楼 2014-03-28 09:06:13

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

fangsteel

木虫 (正式写手)

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专业: 原子和分子物理

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
eva_dan: 金币+3, ★★★很有帮助 2014-03-28 16:21:12
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2014-03-28 20:44:31

第一个方法，按住1来选择找到这个碱基原子的index文件，找到这些原子的对应的原子序数，然后从最开始的gro或者pdb文件中来删除原子
第二个方法，在vmd中选择all and not （）命令来选择自己所要的原子然后对应的输出其余原子的pdb文件就行

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