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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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eva_dan

金虫 (小有名气)

[求助] 用VMD构建DNA分子时 如何删除其中部分原子 构建一个缺陷? 已有1人参与

用VMD构建DNA分子时 如何删除其中一个地方的碱基  构建一个缺陷?  刚刚学习这个软件 在说明书里 也找不到对应的方法~~~    求助额 感激不尽~~~     说删除的地方 也要加上力场  这个怎么加呢??
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fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
eva_dan: 金币+3, ★★★很有帮助 2014-03-28 16:21:12
月只蓝: 金币+2, 感谢指导! 2014-03-28 20:44:31
第一个方法,按住1来选择找到这个碱基原子的index文件,找到这些原子的对应的原子序数,然后从最开始的gro或者pdb文件中来删除原子
第二个方法,在vmd中选择all and not ()命令来选择自己所要的原子然后对应的输出其余原子的pdb文件就行
gromacs
2楼2014-03-28 12:22:41
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