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leewz922

金虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】VMD如何选定重原子

我想选定分子中的重原子，即除了氢之外的原子，在VMD的 TKcole输入，set X [atomselect top "protein not name "H.*""] 但是选定不了，提示extra characters after close-quote。百思不得其解，忘高手赐教。怎么用VMD选定除了氢原子之外的原子？

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1楼 2010-11-21 20:04:38

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sjnyongle

金虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
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★ ★ ★
zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-11-22 15:38:57
leewz922(金币+10):Absolutely right! 10分感谢！ 2010-11-22 21:06:48

命令：set x [atomselect top "protein and noh" ]
你可以用$x num
查看x定义的原子跟你的protein中的重原子是否相符。
希望有帮到你!

赞一下(1人)

2楼2010-11-22 15:36:43

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

wdali

金虫 (正式写手)

应助: 9 (幼儿园)
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★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+1):新手也威武~哈哈 2010-11-24 23:56:34

直接not hydrogen 行不行？小弟新手，勿喷

赞一下(2人)

3楼2010-11-24 09:22:24

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leewz922

金虫 (小有名气)

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引用回帖:

Originally posted by wdali at 2010-11-24 09:22:24:
直接not hydrogen 行不行？小弟新手，勿喷

可以的，not hydrogen 和noh一样的
set x [atomselect top "protein and not hydrogen"] 就把除了氢原子都选上了

4楼2010-11-24 15:33:15

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