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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » CASTEP优化问题
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幸雪冰

新虫 (初入文坛)

[求助] CASTEP优化问题 已有3人参与

各位大神，本人更接触MS，不太懂，求帮助
我用CASTEP优化一个有机大分子，大概70个原子，台式机计算，不是工作站
一天了，一直显示的是running，但是进程没有数据，是没插网线的原因吗？还是计算很慢
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1楼 2014-03-26 18:43:31
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

729267452lgl

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-04-14 21:38:08
没有关系，应该是体系太大，但是你的电脑配置太低，计算的太慢了，一天没有计算出一个点，你可以查看一下远程服务器上的计算文件，看一下计算了多少了。直接在任务栏中选择正在计算的任务，然后右键点击，选择远程查看，就可以了。如果你计算的时候只选择了一个核的话，插不插网线都没有关系，如果多于一个核，不插网线，无法提交任务，所以这一点不用担心。
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2楼2014-03-27 09:22:33
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-04-14 21:38:23
有机大分子（尤其不是分子晶体的情况，气相），往往需要很大的盒子，但是CASTEP计算量依赖盒子的大小，因此我采用CASTEP觉得有些不合适。如同前辈所说，空体积较大的时候建议Dmol3.

如果一定需要解决上述CASTEP造成的问题，建议把返回的*.castep文件的结尾几段发来看看。
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不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
5楼2014-04-03 09:16:28
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-04-14 21:38:30
引用回帖:
6楼: Originally posted by 幸雪冰 at 2014-04-04 18:39:42
就是现在我换了很小的空间盒子，能运行，做优化，但是结果一直没有能量变化图和收敛图出现，请教一下这又是为什么呢？只有文件出现...

我指的是，castep计算孤立的分子必须采用很大的盒子才能保证分子是孤立的，否则模型不合理很有可能导致scf不收敛，即便得到结果也是没啥意义的。

你的意思可能有点模糊，我不太了解你是计算成功了还是还在那边算，如果计算成功，但是没出现收敛过程的曲线，你可以在analysis-energy evolution-import得到这个图。如果你的进程还在计算，有两种情况：

对于windows，只能通过MS中的进程栏右键你的进程-remote view，此时IE显示了你的gateway中的内容，打开*.castep文件，里面记录了当前计算中每一步的convergence，你可以看看是不是因为没收敛。

对于linux也可采用类似的方法，更快捷的就是cd 在MS的目录下的/etc/Gateway/dsd/jobs/你任务的编号/，然后tail -f *.castep，来观测你的convergence
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不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
7楼2014-04-04 19:33:54
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幸雪冰

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 729267452lgl at 2014-03-27 09:22:33
没有关系，应该是体系太大，但是你的电脑配置太低，计算的太慢了，一天没有计算出一个点，你可以查看一下远程服务器上的计算文件，看一下计算了多少了。直接在任务栏中选择正在计算的任务，然后右键点击，选择远程查 ...

我现在换到工作站计算，但是每次计算到最后都会显示失败，这是为什么？
CASTEP优化问题
)HPS]_S7ZVF2_)EXM$8%S@B.jpg
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3楼2014-04-02 09:26:55
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729267452lgl

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-04-14 21:38:14
引用回帖:
3楼: Originally posted by 幸雪冰 at 2014-04-02 09:26:55
我现在换到工作站计算，但是每次计算到最后都会显示失败，这是为什么？

)HPS]_S7ZVF2_)EXM$8%S@B.jpg
...

这时你应该看一下Castep的结果文件，里边应该会有出错的原因，有可能是你的电脑计算能力不够，或者是内存不足。

[ 发自小木虫客户端 ]
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4楼2014-04-03 07:44:07
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幸雪冰

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-04-03 09:16:28
有机大分子（尤其不是分子晶体的情况，气相），往往需要很大的盒子，但是CASTEP计算量依赖盒子的大小，因此我采用CASTEP觉得有些不合适。如同前辈所说，空体积较大的时候建议Dmol3.

如果一定需要解决上述CASTEP造 ...

就是现在我换了很小的空间盒子，能运行，做优化，但是结果一直没有能量变化图和收敛图出现，请教一下这又是为什么呢？只有文件出现
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6楼2014-04-04 18:39:42
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gsq920306278

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-04-14 21:38:39
这是台机算不动了，找台比你台机性能好的电脑再试试，不行拿服务器算。
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自己才是自己最大的敌人。
8楼2014-04-05 08:17:06
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幸雪冰

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-04-04 19:33:54
我指的是，castep计算孤立的分子必须采用很大的盒子才能保证分子是孤立的，否则模型不合理很有可能导致scf不收敛，即便得到结果也是没啥意义的。

你的意思可能有点模糊，我不太了解你是计算成功了还是还在那边算 ...

我看了castep里面的文件，显示是没收敛，所以每次都失败，但是我现在的结构是导入的structure里面的沸石，然后建的盒子，所以不收敛我会感到很奇怪，因为它的结构是没问题的
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9楼2014-04-14 20:36:09
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

你要看你的计算到底如何了，之需要在浏览器中输入你的服务器IP地址加网关，比如：http://49.123.104.5:18888/
网页下面就会显示你现在计算的所有数据，点击*.castep,查看现在计算到哪里了。

你计算一直没有出现数据，是你的第一步自洽一直再算，所以一直都不会有能量收敛值显示出来。但是你可以按照我说的看看你的能量是否收敛，并可以监控计算过程。
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10楼2014-04-14 22:33:02
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