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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » MS中 castep 优化结构出现以下错误，请问怎么解决？
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对马拉二胡

至尊木虫 (职业作家)

[求助] MS中 castep 优化结构出现以下错误，请问怎么解决？ 已有3人参与

刚点Run， 就出现了

2014/02/28@11:38:47  [26XS0] - 2 CASTEP GeomOpt ERROR The file 2_1.param is either not readable or missing
2014/02/28@11:38:58  [26XS0] - 2 CASTEP GeomOpt ERROR Error on Job Complete. Results file is invalid.
2014/02/28@11:38:59  [26XS0] - 2 CASTEP GeomOpt ERROR Files not removed from server due to previous errors.
2014/02/28@11:38:59  [26XS0] - 2 CASTEP GeomOpt WARN As instructed, files have been left on remote server, these may need to be manually archived.

这是怎么回事啊？？
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1楼 2014-01-02 11:49:16
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

Mrbarak

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

今天也遇见了这个问题，仔细看了下CASTEP的官方文档，（https://www.tcm.phy.cam.ac.uk/ca ... lone.htm#generation）程序运行的命令： RunCASTEP.sh [-h] [-np number of cores] [-nt number of threads] [-q queue name] seedname (Linux)
注意里面的seedname 是不能加后缀的。去掉后缀就可以正常运行了。
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物极必反
10楼2020-07-05 14:59:06
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普通回帖

零下1℃

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
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sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2014-01-03 10:02:41
从错误提示中可以看出提示的都是文件不可读，丢失。所以本人感觉是MS在安装的时候出错，建议彻底清空在重新安装一次，希望能够有帮助
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2楼2014-01-02 15:07:35
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对马拉二胡

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 零下1℃ at 2014-01-02 15:07:35
从错误提示中可以看出提示的都是文件不可读，丢失。所以本人感觉是MS在安装的时候出错，建议彻底清空在重新安装一次，希望能够有帮助

今天我把截断能调大了做收敛性测试发现可以运行，但到中途又出现以下错误，忘赐教。
+---------------- MEMORY AND SCRATCH DISK ESTIMATES PER NODE -----------------+
|                                                     Memory          Disk    |
| Model and support data                              920.3 MB       101.2 MB |
| Electronic energy minimisation requirements         682.0 MB       455.1 MB |
|                                               ----------------------------- |
| Approx. total storage required per node            1602.3 MB       556.4 MB |
|                                                                             |
| Requirements will fluctuate during execution and may exceed these estimates |
+-----------------------------------------------------------------------------+
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF
SCF loop      Energy                           Energy gain       Timer   <-- SCF
                                               per atom          (sec)   <-- SCF
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF
Initial  -3.68233747E+003                                        541.08  <-- SCF
Trapped SIGINT or SIGTERM. Exiting...
Trapped SIGINT or SIGTERM. Exiting...
MPI Application rank 0 killed before MPI_Finalize() with signal 9
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3楼2014-01-03 10:18:51
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零下1℃

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 对马拉二胡 at 2014-01-03 10:18:51
今天我把截断能调大了做收敛性测试发现可以运行，但到中途又出现以下错误，忘赐教。
+---------------- MEMORY AND SCRATCH DISK ESTIMATES PER NODE -----------------+
|                                     ...

LZ在调大截断能进行收敛性计算的时候，必然会使得计算所需的内存增大。从错误提示可以看出，LZ所使用的计算机性能远不能满足LZ计算的需要。你这次的错误源于你的硬件问题。例如：所需内存920.3MB，而DISK（硬盘）能够提供的是101.2MB。希望能够给你带来帮助。
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4楼2014-01-03 10:24:58
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对马拉二胡

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 零下1℃ at 2014-01-03 10:24:58
LZ在调大截断能进行收敛性计算的时候，必然会使得计算所需的内存增大。从错误提示可以看出，LZ所使用的计算机性能远不能满足LZ计算的需要。你这次的错误源于你的硬件问题。例如：所需内存920.3MB，而DISK（硬盘）能 ...

非常感谢，但是我用的服务器内存是8个G的，为什么会这样呢？
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5楼2014-01-03 10:37:46
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零下1℃

铁虫 (正式写手)
★ ★
sunyang1988: 金币+2, 谢谢交流 2014-01-03 21:57:47
引用回帖:
5楼: Originally posted by 对马拉二胡 at 2014-01-03 10:37:46
非常感谢，但是我用的服务器内存是8个G的，为什么会这样呢？...

这个我还真是不知道为什么，我也只能从给出的错误提示中做出判断。不过我建议楼主，截断能降低，原子个数降低，算一个小一点的体系看看怎么样，我们一般在刚开始验证计算的时候，是不应该做特别大的精度高的计算，LZ可以算小的试试再说。
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6楼2014-01-03 10:55:28
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wfbgc

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2014-01-03 21:57:51
你在计算的时候把 memory选中 试一下
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7楼2014-01-03 13:18:49
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对马拉二胡

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 零下1℃ at 2014-01-03 10:55:28
这个我还真是不知道为什么，我也只能从给出的错误提示中做出判断。不过我建议楼主，截断能降低，原子个数降低，算一个小一点的体系看看怎么样，我们一般在刚开始验证计算的时候，是不应该做特别大的精度高的计算， ...

谢谢指点， 我想应该是内存不够的原因。
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8楼2014-01-04 08:42:10
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对马拉二胡

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
7楼: Originally posted by wfbgc at 2014-01-03 13:18:49
你在计算的时候把 memory选中 试一下

我没有找到memory 这个选项啊。用的MS5.0。能告诉一下在哪里不？
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9楼2014-01-04 08:44:21
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