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1164028932金虫 (初入文坛)
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如何让计算离子从晶体内部扩散到表面的能量？
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钡长石晶体在硫酸盐环境中，内部的的钡离子会扩散出去和硫酸根生成硫酸钡，图中的绿颜色的离子是钡离子，怎么样计算钡离子扩散出去的能量呢? 钡长石晶体结构.png [ Last edited by 1164028932 on 2014-3-16 at 19:35 ] |
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franch: 金币+3, 谢谢回帖交流。。。 2014-03-31 22:24:48
franch: 金币+3, 谢谢回帖交流。。。 2014-03-31 22:24:48
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肯定要构造一个表面，这个表面就是3L前辈说的暴露面，如果实验能够确定是最好的，如果单单从First Principle的话，至少几个基本面都要看看。然后构造表面，这个从体结构cleave就行了（注意层数要足够高，晶面要足够大）。优化离子未脱出（嵌入）的模型，另外建立一个离子脱出（也许）呈吸附状态的模型，也优化一下，一般从表面的格子扩散到表面应该不会出现别的中间体，所以在这两个状态之间的应该就是过渡态。然后使用Tools-reaction preview，脱出前的（优化好的）xsd文件作为reactant,脱出后的（优化好的）作为product，把迁移过程中对应的atom一个个match一下，全部match后就可以preview。此时就构造出的xtd就是path的轨迹。在xtd上做TS search即可。不过TS confirm用的NEB的方法，相当费时间。 |
9楼2014-03-28 23:17:42
hakuna
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sunyang1988: 金币+2, 谢谢交流 2014-03-28 09:50:39
1164028932: 金币+105, ★★★★★最佳答案, 回答很好，能否具体说说怎么算扩散能垒 2014-03-28 16:15:32
1164028932: 回帖置顶 2014-03-28 20:53:20
sunyang1988: 金币+2, 谢谢交流 2014-03-28 09:50:39
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1164028932: 回帖置顶 2014-03-28 20:53:20
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1.仔细研究一下晶体结构，看看有哪些可能的扩散通道； 2.确定晶体可能的暴露面； 3.将上述两点结合起来，确定离子扩散方式，然后象处理化学反应那样，算扩散能垒 4.如果无法确定扩散通道，那就把可能情况都做一下，比较讨论 仅供参考 |
3楼2014-03-28 09:26:21
hakuna
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1164028932: 回帖置顶 2014-03-28 20:53:12
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我用vasp. 你用ms吗？这个我不熟悉，发一个ppt给你，里面有很大篇幅讨论过渡态搜索问题以及参数设置方法，你参考一下。主要用dmol3模块 |
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2014-03-28 19:51:26, 7.08 M
5楼2014-03-28 19:52:04
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