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钢金术师

金虫 (小有名气)

[求助] CNEB搜索的结果处理 已有1人参与

小虫目前在做NEB搜索,遇到一些问题,请教一下各位虫友:

1.经过CNEB搜索之后,使用VTST的脚本命令nebresults.pl,并没有生成movie.xyz文件,生成的是movie.vasp文件,生成的movie文件用VMD打不开,请问该如何查看动态的过程。
2.在exts.dat文件里生成的可能的极值点,格式是
                                                      Extrema 3 found at image  2.999114 with energy:  0.071851
这个应该说是在第2.9999个images处是个极值点吧,但是这个2.9999个极值点的构型在
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葵cc_

木虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 钢金术师 at 2015-06-10 11:24:02
不好意思才恢复你,你试一下最新版本的vasptools官网上的脚本...

你是这么做出来的吗?
我用的的vasp版本是5.3的,NEB是http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/download.html 网站上的Version: 3.1, Mar. 28, 2014 (compatible with vasp.5.3.x)版本。
两个月前才编译好的,应该算是最新的版本了吧?
9楼2015-06-10 15:55:19
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cyyweiqing

银虫 (小有名气)

楼主,你的问题解决了么?  我也遇到相同的问题了,如果你解决了能不能分享一下解决方法?  怎样查看movie.vasp
2楼2014-06-06 20:08:29
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钢金术师

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cyyweiqing at 2014-06-06 20:08:29
楼主,你的问题解决了么?  我也遇到相同的问题了,如果你解决了能不能分享一下解决方法?  怎样查看movie.vasp

输入命令之后会在每个文件夹中分别产生一个movie,吧这几个按顺序放到一个movie里面(就是吧一个movie里面的文件都复制,然后依次粘贴到文本中),然后用VMD就可以打开
3楼2014-06-06 21:38:31
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葵cc_

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

第2点,应该是第3个image处是个极值,2.999是它的坐标。
势垒的最低点最高点都是极值的位置。
4楼2015-06-03 09:46:06
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