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CNEB搜索的结果处理
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钢金术师
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CNEB搜索的结果处理
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小虫目前在做NEB搜索,遇到一些问题,请教一下各位虫友:
1.经过CNEB搜索之后,使用VTST的脚本命令nebresults.pl,并没有生成movie.xyz文件,生成的是movie.vasp文件,生成的movie文件用VMD打不开,请问该如何查看动态的过程。
2.在exts.dat文件里生成的可能的极值点,格式是
Extrema 3 found at image 2.999114 with energy: 0.071851
这个应该说是在第2.9999个images处是个极值点吧,但是这个2.9999个极值点的构型在
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1楼
2014-03-12 18:42:40
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Originally posted by
钢金术师
at 2014-06-06 21:38:31
输入命令之后会在每个文件夹中分别产生一个movie,吧这几个按顺序放到一个movie里面(就是吧一个movie里面的文件都复制,然后依次粘贴到文本中),然后用VMD就可以打开...
你好,输入nebresults.pl命令之后,只会产生一个movie.vasp和movie,几个image的文件夹下面没有产生movie,请问你是输入什么命令产生的?
谢谢~~
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5楼
2015-06-03 09:48:06
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楼主,你的问题解决了么? 我也遇到相同的问题了,如果你解决了能不能分享一下解决方法? 怎样查看movie.vasp
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2楼
2014-06-06 20:08:29
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2楼
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Originally posted by
cyyweiqing
at 2014-06-06 20:08:29
楼主,你的问题解决了么? 我也遇到相同的问题了,如果你解决了能不能分享一下解决方法? 怎样查看movie.vasp
输入命令之后会在每个文件夹中分别产生一个movie,吧这几个按顺序放到一个movie里面(就是吧一个movie里面的文件都复制,然后依次粘贴到文本中),然后用VMD就可以打开
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3楼
2014-06-06 21:38:31
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【答案】应助回帖
第2点,应该是第3个image处是个极值,2.999是它的坐标。
势垒的最低点最高点都是极值的位置。
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4楼
2015-06-03 09:46:06
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