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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 求助，从土壤中分离出的细菌，如何进行生理生化和分子生物学鉴定
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clavicle

铜虫 (小有名气)

[求助] 求助，从土壤中分离出的细菌，如何进行生理生化和分子生物学鉴定 已有6人参与

跨学科，所以这个问题比较头疼，菌株鉴定对整个论文的影响不大，但是是必不可少的一部分，但是没有经验，还得向各位前辈请教。请问如何最快速准确的鉴定该菌株到底是什么。。

有没有相关机构可以做此类测试的？？谢谢！！！
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向日葵只在白天才能仰起头来
1楼 2014-03-06 16:24:13
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
不知道你们菌种鉴定需要到什么水平，如果需要详细鉴定，全套下来至少3万，如果只是鉴定是啥菌，扩个16S rDNA,克隆后测序即可。。
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3楼2014-03-07 15:36:33
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benedictchau

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★
dllchina: 金币+3, MicEPI+1, good 2014-03-09 19:13:28
dllchina: MicEPI-1, good 2014-03-09 19:14:40
生理生化实验可以去CICC保藏中心或者微生物所做，这些实验实际上不是很难，只不过需要花时间  可以通过试剂条进行。单纯想找哪个菌的话16S测序之后  blast进行比较 就能大概确定了
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8楼2014-03-09 16:45:49
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普通回帖

王贤卓

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+2, 鼓励应助！ 2014-03-07 15:10:13
生理生化可参照“伯杰氏细菌鉴定手册”。分子鉴定可以测定16s rDNA（分子手段好多，还有GC含量测定。。。。），然后构建系统发育树。菌种保藏中心，可提供鉴定工作。。。一般生物实验室也可以搞定
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2楼2014-03-07 09:21:22
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clavicle

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by dllchina at 2014-03-07 15:36:33
不知道你们菌种鉴定需要到什么水平，如果需要详细鉴定，全套下来至少3万，如果只是鉴定是啥菌，扩个16S rDNA,克隆后测序即可。。

嗯，我就是想要鉴定是什么菌。
现在测了序列了，然后要怎么办啊？谢谢大神！！
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向日葵只在白天才能仰起头来
4楼2014-03-08 14:35:26
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clavicle

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 王贤卓 at 2014-03-07 09:21:22
生理生化可参照“伯杰氏细菌鉴定手册”。分子鉴定可以测定16s rDNA（分子手段好多，还有GC含量测定。。。。），然后构建系统发育树。菌种保藏中心，可提供鉴定工作。。。一般生物实验室也可以搞定

我有了序列，请问那个系统发育树要怎么构建啊？
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向日葵只在白天才能仰起头来
5楼2014-03-08 14:36:04
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dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by clavicle at 2014-03-08 14:36:04
我有了序列，请问那个系统发育树要怎么构建啊？...

站内搜索~进化树构建，帖子很多的
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6楼2014-03-08 14:38:04
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clavicle

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by dllchina at 2014-03-08 14:38:04
站内搜索~进化树构建，帖子很多的...

额。还有那个生理生化测试。。您知道哪里能做么，我在北京。。
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向日葵只在白天才能仰起头来
7楼2014-03-09 11:05:46
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王贤卓

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by clavicle at 2014-03-08 14:36:04
我有了序列，请问那个系统发育树要怎么构建啊？...

MEGA软件
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9楼2014-03-11 09:12:15
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quiller2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

按照IJSEM的要求做就可以了

我可以做
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致良知
10楼2014-05-15 19:46:14
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