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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 有没有用 lj势函数 模拟lammps的朋友？
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wangyisheng

金虫 (小有名气)

[求助] 有没有用 lj势函数 模拟lammps的朋友？ 已有1人参与

lj势函数有像eam这样的文件吗？potential文件夹中没有找到，如果有，那它的格式和eam的setfl以及funcfl格式有区别吗？
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1楼 2014-03-05 11:02:48
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zhang53201

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-03-05 18:23:39
wangyisheng: 金币+20, ★★★很有帮助 2014-03-06 15:36:55
lj势函数只有几个参数需要给定，所以就没有类似eam的文件了。
你在input里面只用说明要使用lj势函数，它的参数是多少，就可以了。

比如，

pair_style lj/cut 2.5  #指定截断半径
pair_coeff * * 1 1  #指定sigma和那个e的值。
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2楼2014-03-05 11:23:19
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wangyisheng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhang53201 at 2014-03-05 11:23:19
lj势函数只有几个参数需要给定，所以就没有类似eam的文件了。
你在input里面只用说明要使用lj势函数，它的参数是多少，就可以了。

比如，

pair_style lj/cut 2.5  #指定截断半径
pair_coeff * * 1 1  #指定 ...

我看manuel说，关于lj势函数的命令主要有charmm和class2两种，而charmm主要是用于非溶剂化的生物分子，而我想做Ag和O的体系，应该用哪一种lj势函数？，，，，，，原本不想用lj，但只有一篇文献中提到了Ag与O的体系，用的是lj势函数。“Ag-Al-O体系中纳米Ag形成过程研究”，，，，，，，不过文献中也没提及势参数，其参考文献中也没有。
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3楼2014-03-05 15:29:53
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zhang53201

铜虫 (小有名气)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-05 18:23:45
引用回帖:
3楼: Originally posted by wangyisheng at 2014-03-05 15:29:53
我看manuel说，关于lj势函数的命令主要有charmm和class2两种，而charmm主要是用于非溶剂化的生物分子，而我想做Ag和O的体系，应该用哪一种lj势函数？，，，，，，原本不想用lj，但只有一篇文献中提到了Ag与O的体系 ...

我看到nist上面有Ag和O的势函数，lj的不好用，就用eam的吧。

http://www.ctcms.nist.gov/potentials/O.html
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4楼2014-03-05 18:04:17
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wangyisheng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhang53201 at 2014-03-05 18:04:17
我看到nist上面有Ag和O的势函数，lj的不好用，就用eam的吧。

http://www.ctcms.nist.gov/potentials/O.html...

如果能用EAM，是最好的。如果有Ta存在，这会影响银和氧之间的关系吗？如果没有影响，如何能够屏蔽Ta，只使用银和氧之间的关系？
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5楼2014-03-05 18:17:49
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zhang53201

铜虫 (小有名气)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-06 19:07:58
引用回帖:
5楼: Originally posted by wangyisheng at 2014-03-05 18:17:49
如果能用EAM，是最好的。如果有Ta存在，这会影响银和氧之间的关系吗？如果没有影响，如何能够屏蔽Ta，只使用银和氧之间的关系？...

pair_style eam/alloy
pair_coeff * * ../potentials/NiAlH_jea.eam.alloy Ni Al Ni Ni

比如这个例子，没有用到H，在后面就不指定H了。
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6楼2014-03-06 13:44:49
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wangyisheng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zhang53201 at 2014-03-06 13:44:49
pair_style eam/alloy
pair_coeff * * ../potentials/NiAlH_jea.eam.alloy Ni Al Ni Ni

比如这个例子，没有用到H，在后面就不指定H了。...

到的，多谢了！
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7楼2014-03-06 15:36:28
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