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月之蔻

铜虫 (初入文坛)

[求助] Miseq 数据处理 已有1人参与

Hi,我在Miseq genomics这块一片空白，也没有培训。
我从测序公司得到的了fastq原始数据，想要采用mothur进行分析，读了mothur-sop，但是还是不清楚下一步怎么做。甚至不清楚每个文件的含义。
请教高手提点，我该如何下手？最好有教程，详细的入门教程。不胜感激。。
fastq文件是不是可以直接用来分析，fastq 是细菌的序列吗？
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1楼 2014-03-05 02:39:20
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月之蔻

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ironicsjq at 2014-03-06 18:14:18
如果是基因组测序数据，这个比较复杂，没法详细说。

如果是用miseq测的16S的数据，用qiime可以比较容易上手，他们网站上的教程也比较直观。http://qiime.org/

我的是miseq测的16S的数据
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互帮互助，积善成德；超越梦想，不是梦想！
4楼2014-03-07 14:18:20
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ironicsjq

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月之蔻: 金币+2, ★有帮助 2014-03-07 14:17:28
如果是基因组测序数据，这个比较复杂，没法详细说。

如果是用miseq测的16S的数据，用qiime可以比较容易上手，他们网站上的教程也比较直观。http://qiime.org/
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2楼2014-03-07 10:14:18
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月之蔻

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ironicsjq at 2014-03-06 18:14:18
如果是基因组测序数据，这个比较复杂，没法详细说。

如果是用miseq测的16S的数据，用qiime可以比较容易上手，他们网站上的教程也比较直观。http://qiime.org/

谢谢。
我觉得mothur功能强大，在使用这个软件。您有这个软件的相关中文教程吗？
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3楼2014-03-07 14:17:37
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暖暖花开

新虫 (初入文坛)
你好，你现在会用了mothur了吗
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5楼2016-05-13 15:33:16
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