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月之蔻

铜虫 (初入文坛)

[求助] Miseq 数据处理已有1人参与

Hi,我在Miseq genomics这块一片空白,也没有培训。
我从测序公司得到的了fastq原始数据,想要采用mothur进行分析,读了mothur-sop,但是还是不清楚下一步怎么做。甚至不清楚每个文件的含义。
请教高手提点,我该如何下手?最好有教程,详细的入门教程。不胜感激。。
fastq文件是不是可以直接用来分析,fastq 是细菌的序列吗?
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互帮互助,积善成德;超越梦想,不是梦想!
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ironicsjq

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月之蔻: 金币+2, 有帮助 2014-03-07 14:17:28
如果是基因组测序数据,这个比较复杂,没法详细说。

如果是用miseq测的16S的数据,用qiime可以比较容易上手,他们网站上的教程也比较直观。http://qiime.org/
2楼2014-03-07 10:14:18
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月之蔻

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ironicsjq at 2014-03-06 18:14:18
如果是基因组测序数据,这个比较复杂,没法详细说。

如果是用miseq测的16S的数据,用qiime可以比较容易上手,他们网站上的教程也比较直观。http://qiime.org/

谢谢。
我觉得mothur功能强大,在使用这个软件。您有这个软件的相关中文教程吗?
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3楼2014-03-07 14:17:37
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月之蔻

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ironicsjq at 2014-03-06 18:14:18
如果是基因组测序数据,这个比较复杂,没法详细说。

如果是用miseq测的16S的数据,用qiime可以比较容易上手,他们网站上的教程也比较直观。http://qiime.org/

我的是miseq测的16S的数据
互帮互助,积善成德;超越梦想,不是梦想!
4楼2014-03-07 14:18:20
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暖暖花开

新虫 (初入文坛)

你好,你现在会用了mothur了吗
5楼2016-05-13 15:33:16
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梦想不是梦想

新虫 (初入文坛)

您好,mothur学会了嘛?能不能请教你几个问题
6楼2017-10-11 20:58:35
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