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月之蔻

铜虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 172.3
帖子: 18
在线: 12.6小时
虫号: 1347868
注册: 2011-07-16
性别: MM
专业: 微生物生态学

[求助] Miseq 数据处理已有1人参与

Hi,我在Miseq genomics这块一片空白，也没有培训。
我从测序公司得到的了fastq原始数据，想要采用mothur进行分析，读了mothur-sop，但是还是不清楚下一步怎么做。甚至不清楚每个文件的含义。
请教高手提点，我该如何下手？最好有教程，详细的入门教程。不胜感激。。
fastq文件是不是可以直接用来分析，fastq 是细菌的序列吗？

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互帮互助，积善成德；超越梦想，不是梦想！

1楼2014-03-05 02:39:20

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ironicsjq

新虫 (初入文坛)

应助: 2 (幼儿园)
金币: 5.6
帖子: 4
在线: 47分钟
虫号: 220198
注册: 2006-03-14
专业: 环境微生物学

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月之蔻: 金币+2, ★有帮助 2014-03-07 14:17:28

如果是基因组测序数据，这个比较复杂，没法详细说。

如果是用miseq测的16S的数据，用qiime可以比较容易上手，他们网站上的教程也比较直观。http://qiime.org/

2楼2014-03-07 10:14:18

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