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zhuimeng08银虫 (正式写手)
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gromacs 处理小分子配体，其电荷怎么处理？ 已有1人参与
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我用gromacs 做分子动力学，用http://davapc1.bioch.dundee.ac.uk/cgi-bin/prodrg/run.html 这个网址算出的小分子配体top文件的电荷是错误的。 所以又用了高斯计算，但是高斯中是包含配体小分子的非极性氢的，但是此网站计算的电荷不包括，（高斯计算的小分子配体的非极性氢的电荷如何处理？）请问这个问题，怎么解决？？ |
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jianjunjiang
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5楼2014-03-12 11:00:09