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zhuimeng08银虫 (正式写手)
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gromacs 处理小分子配体,其电荷怎么处理? 已有1人参与
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我用gromacs 做分子动力学,用http://davapc1.bioch.dundee.ac.uk/cgi-bin/prodrg/run.html 这个网址算出的小分子配体top文件的电荷是错误的。 所以又用了高斯计算,但是高斯中是包含配体小分子的非极性氢的,但是此网站计算的电荷不包括,(高斯计算的小分子配体的非极性氢的电荷如何处理?)请问这个问题,怎么解决?? |
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zhuimeng08
银虫 (正式写手)
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