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Carnity

新虫 (正式写手)

应助: 2 (幼儿园)
金币: 274.9
散金: 164
红花: 6
沙发: 1
帖子: 422
在线: 80.9小时
虫号: 2415968
注册: 2013-04-13
性别: GG
专业: 生物大分子结构与功能

[求助] CNV（拷贝数变异）的研究方法已有1人参与

各位虫友们，偶又来问问题了。
最近在分析一个基因，据报道可能存在个体拷贝数的差异，有一条BAC文库测序的数据支持，但不清楚这种CNV是否普遍存在，所以想看一下这个基因是不是存在CNV现象，如果存在，可能会研究后续的功能方面的差异。ps：两个cds相距2-3kb，核酸序列相似度达97%左右，特请教：
1. 用什么方法可以证明确实存在CNV；

2. 若做后续研究可以从哪些方面着手；

3. 若做调控不知道有什么方法可参考？

还望大家提点迷思，给点参考建议……

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请问研究“机制”，“方法”，”路径“，”机理“之间的区别？已经有21人回复

1楼 2014-02-21 13:47:33

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

a东莨菪碱

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
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虫号: 3127553
注册: 2014-04-11
专业: 消化系统疾病诊疗新技术

我和你遇到了同样的问题；
CNV检测有两种方法，一种是基因芯片的方法，一代测序就可以搞定，但是成本较高，而且得看你的基因在人群中CNV的机率，否则样本量低的情况下，出阳性结果的机率要低。第二种就是RT-PCR方法，使用探针，根据荧光强度的多少，来计算相对改变的值。AB有探针的成品。
我也在研究这个，共同学习。