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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Molpro/Molcas » Molpro内存不足
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tiechong

金虫 (著名写手)

[交流] Molpro内存不足 已有9人参与

比如每个核有2GB的内存，我用了"memory,192,m"，按照Molpro的说明，是每个核用了192MW=1.5GB内存，可是每次都任务终止，提示"insufficient memory available - require 110715156  have  80466536"，难道是说我只有80MW=640MB内存？
于是我就增加核的个数，用64个，128个总行吧？每个核1.5G, 我64个核96G内存了。可是还是同样的错误信息。
于是我就问Molpro，人家答复说：内存的需求不是所有核的累计，不管你用1个核还是100个核，每个核所需要的内存都是一样的。难道我得增加单个核的内存？可是俺们这每个核却只有2GB的内存啊（已经设了1.5GB了）

用过Molpro的虫子出来说说。难道算Molpro的单核都必须有远大于2GB的内存？比如全部是5GB甚至10GB一个核？

我也就是算算CASPT2(5,5),20个原子，一个过渡金属原子，没有对称性

[ Last edited by tiechong on 2014-2-17 at 06:55 ]
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1楼 2014-02-17 06:53:00
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fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
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gmy1990: 金币+2 2014-02-19 01:30:19
引用回帖:
7楼: Originally posted by tiechong at 2014-02-18 13:10:37
每个cpu有2GB的内存，每个node有8个cpu...

从一开始我就很奇怪“每个cpu有2GB的内存”这种说法...内存跟cpu有这种联系的吗？在总内存足够的时候，分配给单个cpu的内存难道不是想多大就多大吗...
楼主的意思如果是指每个node有8个cpu和16G内存，那可以试试四核或更少核...
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9楼2014-02-18 13:38:21
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普通回帖

qchem

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请molpro是怎么购买的，多少钱？
这个计算实际需要多少内存呢？像Gaussian是可以估算的
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2楼2014-02-17 10:12:19
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kent1022

金虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我也是一样的问题，不是设小了就是大了
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3楼2014-02-17 15:51:57
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fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主列一下机器的配置，总共有多少个cpu，多少内存...
另外列一下输入molpro运算时的命令，以及top命令下看到用了几个cpu...
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4楼2014-02-17 17:38:18
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
★ ★ ★
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gmy1990: 金币+2 2014-02-19 01:30:34
用单核试试吧。molpro的多参考计算不能通过并行提高速度，反而更慢。另外，如果用rs2c模块做caspt2，或者再加上密度拟合和组态筛选，计算速度能提高一两个数量级
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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
5楼2014-02-17 20:52:02
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tiechong

金虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by qchem at 2014-02-17 10:12:19
请molpro是怎么购买的，多少钱？
这个计算实际需要多少内存呢？像Gaussian是可以估算的

组里以前买的，我也不大清楚
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6楼2014-02-18 13:09:00
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tiechong

金虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by fatpig8832 at 2014-02-17 17:38:18
楼主列一下机器的配置，总共有多少个cpu，多少内存...
另外列一下输入molpro运算时的命令，以及top命令下看到用了几个cpu...

每个cpu有2GB的内存，每个node有8个cpu
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7楼2014-02-18 13:10:37
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tiechong

金虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by beefly at 2014-02-17 20:52:02
用单核试试吧。molpro的多参考计算不能通过并行提高速度，反而更慢。另外，如果用rs2c模块做caspt2，或者再加上密度拟合和组态筛选，计算速度能提高一两个数量级

rs2c不能算multi-state caspt2啊，我是要一起解10个态，这个单独解容易遇上收敛的问题吧
如果单独解一个rs2c第2个态该用什么casscf参考态，貌似casscf不能单独解第2个态，

[ Last edited by tiechong on 2014-2-18 at 13:16 ]
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8楼2014-02-18 13:12:59
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十三个西瓜

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
减少核数，增大内存
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10楼2014-02-18 14:07:31
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