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tiechong

金虫 (著名写手)

[交流] Molpro内存不足 已有9人参与

比如每个核有2GB的内存,我用了"memory,192,m",按照Molpro的说明,是每个核用了192MW=1.5GB内存,可是每次都任务终止,提示"insufficient memory available - require 110715156  have  80466536",难道是说我只有80MW=640MB内存?
于是我就增加核的个数,用64个,128个总行吧?每个核1.5G, 我64个核96G内存了。可是还是同样的错误信息。
于是我就问Molpro,人家答复说:内存的需求不是所有核的累计,不管你用1个核还是100个核,每个核所需要的内存都是一样的。难道我得增加单个核的内存?可是俺们这每个核却只有2GB的内存啊(已经设了1.5GB了)

用过Molpro的虫子出来说说。难道算Molpro的单核都必须有远大于2GB的内存?比如全部是5GB甚至10GB一个核?

我也就是算算CASPT2(5,5),20个原子,一个过渡金属原子,没有对称性

[ Last edited by tiechong on 2014-2-17 at 06:55 ]
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fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★
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gmy1990: 金币+2 2014-02-19 01:30:19
引用回帖:
7楼: Originally posted by tiechong at 2014-02-18 13:10:37
每个cpu有2GB的内存,每个node有8个cpu...

从一开始我就很奇怪“每个cpu有2GB的内存”这种说法...内存跟cpu有这种联系的吗?在总内存足够的时候,分配给单个cpu的内存难道不是想多大就多大吗...
楼主的意思如果是指每个node有8个cpu和16G内存,那可以试试四核或更少核...
9楼2014-02-18 13:38:21
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普通回帖

qchem

铁杆木虫 (著名写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请molpro是怎么购买的,多少钱?
这个计算实际需要多少内存呢?像Gaussian是可以估算的
2楼2014-02-17 10:12:19
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kent1022

金虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我也是一样的问题,不是设小了就是大了
3楼2014-02-17 15:51:57
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fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主列一下机器的配置,总共有多少个cpu,多少内存...
另外列一下输入molpro运算时的命令,以及top命令下看到用了几个cpu...
4楼2014-02-17 17:38:18
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gmy1990: 金币+2 2014-02-19 01:30:34
用单核试试吧。molpro的多参考计算不能通过并行提高速度,反而更慢。另外,如果用rs2c模块做caspt2,或者再加上密度拟合和组态筛选,计算速度能提高一两个数量级
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
5楼2014-02-17 20:52:02
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tiechong

金虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by qchem at 2014-02-17 10:12:19
请molpro是怎么购买的,多少钱?
这个计算实际需要多少内存呢?像Gaussian是可以估算的

组里以前买的,我也不大清楚
6楼2014-02-18 13:09:00
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tiechong

金虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by fatpig8832 at 2014-02-17 17:38:18
楼主列一下机器的配置,总共有多少个cpu,多少内存...
另外列一下输入molpro运算时的命令,以及top命令下看到用了几个cpu...

每个cpu有2GB的内存,每个node有8个cpu
7楼2014-02-18 13:10:37
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tiechong

金虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by beefly at 2014-02-17 20:52:02
用单核试试吧。molpro的多参考计算不能通过并行提高速度,反而更慢。另外,如果用rs2c模块做caspt2,或者再加上密度拟合和组态筛选,计算速度能提高一两个数量级

rs2c不能算multi-state caspt2啊,我是要一起解10个态,这个单独解容易遇上收敛的问题吧
如果单独解一个rs2c第2个态该用什么casscf参考态,貌似casscf不能单独解第2个态,

[ Last edited by tiechong on 2014-2-18 at 13:16 ]
8楼2014-02-18 13:12:59
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十三个西瓜

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
减少核数,增大内存
10楼2014-02-18 14:07:31
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