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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

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137167741: 金币+2, 鼓励交流~~ 2014-02-16 10:04:50
137167741: 金币+1, BioEPI+1, 小木虫交流,共同进步~~ 2014-02-16 10:05:22
xiezhancnu: 金币+10 2014-02-20 16:54:21
先看文献http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9521921
然后我的理解和你稍微不同,phred不是测variant,是测测序序列的准确性的。
像你说的phred=10,就是在那个位点得到的碱基有90%的可能性是准确的
这个P的计算有点像machine learning,phred程序中保存了大量的数据。这些数据来源于测已知序列,记录了测序波形和精度与正确碱基判断之间的关系。然后通过对当前波形和精度的判断,在已知数据中找匹配值,而得到P。
2楼2014-02-11 08:03:04
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