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wangdunzju

新虫 (小有名气)

[求助] 蛋白SDSPAGE电泳遇到分子量漂移,变大30多kDa! 已有1人参与

最近在做蛋白的SDS-PAGE电泳,遇到目的蛋白分子量漂移的现象,请各位大侠给鉴定一下原因:
我的目的蛋白等电点为7.2,基因序列已知,可以预测其分子量为42kDa左右。用TCA-丙酮沉淀法提取总蛋白做WB检验后,证明蛋白分子量与预测的一致。
因为后面要做一些与功能相关的实验,想用可溶的体系提取蛋白。
我于是用不同pH值的提取液(Tris体系),分为5,7,9三个PH梯度分别提取烟草叶片蛋白,四度离心15分钟(13000rpm),然后将每个样品的上清(可溶性组分)与沉淀组分(不溶性组分)分别制样,用于WB检测,结果如下:蛋白SDSPAGE电泳遇到分子量漂移,变大30多kDa!
如图,TCA法杂出42kDa的目的条带,与预测分子量一致;而上清组分中没有杂出目的条带;沉淀组分中在高pH提取液样品中杂出一个约70kDa的目的带!这让我很纠结,怎么分子量会变大呢?蛋白二聚体应该不可能,因为是SDS-page电泳,SDS会打断亚基之间的结构,况且制样时用上样缓冲液煮过10分钟。那么是什么原因使蛋白的表观分子量变大了呢?我怀疑是是不是蛋白与核酸结合导致蛋白跑慢了,但不知道SDS-page电泳会不会导致核酸与蛋白的结合被破坏,所以不敢下这个结论。或者还有什么别的什么因素导致这样的结果?有这方面经验的虫友帮忙诊断一下啊!多谢了!
祝虫友马年有一切!

[ Last edited by wangdunzju on 2014-2-9 at 15:21 ]
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wangdunzju

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by cicelyzh at 2014-02-10 13:56:40
SDS上样缓冲液是否加了巯基乙醇或者DTT?核酸蛋白复合物在SDS作用下一般会被打断。如果你不能确定,可以用核酸酶消化样品后与未做消化的比较。...

SDS上样缓冲液已经含有巯基乙醇和SDS了,既然核酸蛋白复合物在SDS作用下一般会被打断,那看来这个蛋白结合的不是核酸了?
5楼2014-02-11 10:55:41
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wangdunzju

新虫 (小有名气)

有没有遇到过这样情况的大侠帮忙解答啊!!!
2楼2014-02-10 10:03:38
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-02-11 15:19:10
引用回帖:
2楼: Originally posted by wangdunzju at 2014-02-10 10:03:38
有没有遇到过这样情况的大侠帮忙解答啊!!!

SDS上样缓冲液是否加了巯基乙醇或者DTT?核酸蛋白复合物在SDS作用下一般会被打断。如果你不能确定,可以用核酸酶消化样品后与未做消化的比较。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2014-02-10 13:56:40
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

你用TCA方法是怎么提取蛋白质的啊?
我一直用RIPA裂解液提取蛋白质,有一种蛋白在做WB时总是分子量比序列估计值大20多kDa。
4楼2014-02-11 10:52:04
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