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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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793003946

新虫 (初入文坛)

[求助] 用GROMACS 做protein-protein complex的一些问题 已有3人参与

我想求教一下,用GROMACS做蛋白蛋白相互做用的时候那个另外一个蛋白的topol文件怎么处理?谢谢·~~
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彬哥

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-02-20 11:06:17
貌似不用对top文件处理,建立索引文件,对另一蛋白进行处理就行了!
4楼2014-02-20 09:24:43
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查看全部 5 个回答

smutao

禁虫 (著名写手)


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-02-12 16:34:31
本帖内容被屏蔽

2楼2014-01-28 11:13:52
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QQ_Q_Q_QQ

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-02-12 16:34:36
用 #include '...itp'
3楼2014-02-03 17:38:52
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yearzitian

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 彬哥 at 2014-02-20 09:24:43
貌似不用对top文件处理,建立索引文件,对另一蛋白进行处理就行了!

可以详细说明一下吗?本人最近也在研究蛋白-蛋白复合物动力学。思路是把两个蛋白合为一个蛋白,刚做到优化一步两个蛋白就分开了。
好好向上,天天学习!
5楼2014-07-11 13:48:17
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