²é¿´: 4755  |  »Ø¸´: 8

xueyiran2007

Í­³æ (СÓÐÃûÆø)

[ÇóÖú] MSÉú³ÉLammpsµÄdataÎļþ£¬ÎļþÖÐÔ­×ÓµÄÀàÐͺÍ˳Ðò²¢²»ÊÇ×Ô¼ºÏëÒªµÄ£¬ÇëÎÊÈçºÎÐ޸ģ¿ ÒÑÓÐ2È˲ÎÓë

ÎÒÀûÓÃMS½¨Á¢ÁËË®ÔÚÌú±íÃæµÄÄ£ÐÍ£¬²¢µ¼³ödataÎļþ£¬µ«·¢ÏÖÎļþÀïH, OµÄÔ­×ÓÀàÐÍ·Ö±ðÓÐÁ½ÖÖ£¬¶øÇÒH.OµÄatom IDÒ²²»·ûºÏLammpsµÄÒªÇó£¬
LammpsÒªÇó1¸öOºóÃæ¸ú2¸öH£¬µ«ÎÒµÄdataÎļþÖÐH,OµÄatom ID²¢²»Êǰ´ÕÕÕâ¸ö¹æÂÉÀ´µÄ£¬ÇëÎÊ´óÉñ£¬ÕâÖÖÇé¿öÔõô´¦Àí°¡£¿Íò·Ö¸Ð¼¤£¡
Çë¸÷λ´óÉñ°ïСµÜÒ»°Ñ°¡

LammpsÖеÄH,O¹æ¶¨ÈçÏ£º
the atom IDs for the O and 2 H atoms must be consecutive, with the O atom first. This is to enable LAMMPS to "find" the 2 H atoms associated with
each O atom. For example, if the atom ID of an O atom in a TIP4P water molecule is 500, then its 2 H atoms must have IDs 501 and 502.

ÎÒµÄdataÎļþÈçÏ£¬
5437 atoms
   3136 bonds
   1571 angles
      6 dihedrals
      0 impropers

   5 atom types
   3 bond types
   2 angle types
   1 dihedral types

     6.514843568    92.404843568 xlo xhi
    -0.483828184     5.242171816 ylo yhi
     1.713492553    58.973492553 zlo zhi

Masses
   1  55.847000
   2  15.999400
   3  15.999400
   4   1.007970
   5   1.007970
################################
ÎÊÌâ1£ºÍ¨¹ýMasses¿ÉÒÔ¿´µ½£¬ÕâÀïH,OµÄatom type·Ö±ðÓÐ2ÖÖ£¬ÕâÊÇÔõô»ØÊ£¿ÈçºÎÐ޸ģ¿

Atoms # full
2290      1   2 -0.820000    68.712000000     2.863000000    54.397000000   0   0   0 # o*
   2291      1   2 -0.820000    70.143500000     4.294500000    55.828500000   0   0   0 # o*
   2292      1   2 -0.820000    71.575000000     2.863000000    54.397000000   0   0   0 # o*
   2293      1   2 -0.820000    73.006500000     4.294500000    55.828500000   0   0   0 # o*
   2294      1   2 -0.820000    74.438000000     2.863000000    54.397000000   0   0   0 # o*
   2295      1   2 -0.820000    75.869500000     4.294500000    55.828500000   0   0   0 # o*
   2296      1   2 -0.820000    77.301000000     2.863000000    54.397000000   0   0   0 # o*
   2297      1   2 -0.820000    78.732500000     4.294500000    55.828500000   0   0   0 # o*
   2298      1   2 -0.820000    80.164000000     2.863000000    54.397000000   0   0   0 # o*
   2299      1   2 -0.820000    81.595500000     4.294500000    55.828500000   0   0   0 # o*
   2300      1   2 -0.820000    83.027000000     2.863000000    54.397000000   0   0   0 # o*
   2301      1   2 -0.820000    84.458500000     4.294500000    55.828500000   0   0   0 # o*
   2302      1   4  0.410000    52.595500374     2.171500101    19.349500101   0   0   0 # h*
   2303      1   4  0.410000    54.075500010     1.431500000    18.609500000   0   0   0 # h*
   2304      1   4  0.410000    55.458500374     2.171500101    19.349500101   0   0   0 # h*
   2305      1   4  0.410000    56.938500010     1.431500000    18.609500000   0   0   0 # h*
   2306      1   4  0.410000    58.321500374     2.171500101    19.349500101   0   0   0 # h*
   2307      1   4  0.410000    59.801500010     1.431500000    18.609500000   0   0   0 # h*
   2308      1   4  0.410000    61.184500374     2.171500101    19.349500101   0   0   0 # h*
   2309      1   4  0.410000    62.664500010     1.431500000    18.609500000   0   0   0 # h*
   2310      1   4  0.410000    64.047500374     2.171500101    19.349500101   0   0   0 # h*
   2311      1   4  0.410000    65.527500010     1.431500000    18.609500000   0   0   0 # h*
###################################################
ÎÊÌâ2£ºÕâÀïH,OµÄÅÅÁв¢²»·ûºÏlammpsµÄÒªÇó£¬ÇëÎʸ÷λ´óÉñ£¬ÈçºÎÐÞ¸ÄH,OµÄÅÅÁÐ˳Ðò£¿
»Ø¸´´ËÂ¥
LiveandLearn
ÒÑÔÄ   »Ø¸´´ËÂ¥   ¹Ø×¢TA ¸øTA·¢ÏûÏ¢ ËÍTAºì»¨ TAµÄ»ØÌû

ysshj

½ð³æ (СÓÐÃûÆø)

¡ï
ÔÂÖ»À¶: ½ð±Ò+1, ¹ÄÀø½»Á÷ 2014-01-10 19:35:54
¿´¼û»Ø/¿´µÍµÄÌû×Ó¾ÍÈ̲»×¡Áô¸öÃû¡£
ÎÒÒ²ÊÇÐÂÊÖ£¬¼ûÎÅÓÐÏÞ£¬ÇóÖ¸µã¡£

H,OµÄatom type·Ö±ðÓÐ2ÖÖ£¬Õâ¸ö¸ú¾ßÌåÄ£ÐÍÓйء£ÓеÄʱºòΪÁË·Ögroup»òÊÇÉèÊÆº¯Êý·½±ã£¬²»Í¬Î»ÖÃͬÖÖÔ­×Ó¿ÉÒÔÉè²»Ò»ÑùµÄatom type¡£

¸ÄÅÅÁлòÐí¿ÉÒÔÊÔ¸öÍÁ°ì·¨£¬ÓÃmatlab¶ÁÈ¡Îı¾£¬ÔÙ±à³Ìµ÷Õû£¬ÀýÈç¶Ôÿ¸öOËÑË÷¾àÀë×î½üµÄÁ½¸öH£¬ÔÙ°ÑÐÅÏ¢°¤×Å·Å¡£
Ò»¸öÈËÒªÏñÒ»Ö§¶ÓÎé¡£
2Â¥2014-01-10 17:00:14
ÒÑÔÄ   »Ø¸´´ËÂ¥   ¹Ø×¢TA ¸øTA·¢ÏûÏ¢ ËÍTAºì»¨ TAµÄ»ØÌû

Èã´ËÎÞÉù

ľ³æ (СÓÐÃûÆø)

¡¾´ð°¸¡¿Ó¦Öú»ØÌû

¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï
¸Ðл²ÎÓ룬ӦÖúÖ¸Êý +1
ÔÂÖ»À¶: ½ð±Ò+1, ¹ÄÀø½»Á÷ 2014-01-11 07:40:50
xueyiran2007: ½ð±Ò+5, ¡ï¡ï¡ïºÜÓаïÖú 2014-01-12 03:43:29
1.msÎļþµ¼Èëµ½MEÀbdlת³Édata.
2.fortran±à³ÌʵÏÖ¡£

[ ·¢×ÔСľ³æ¿Í»§¶Ë ]
ÈËÀàһ˼¿¼£¬Éϵ۾ͷ¢Ð¦¡£
3Â¥2014-01-11 00:23:25
ÒÑÔÄ   »Ø¸´´ËÂ¥   ¹Ø×¢TA ¸øTA·¢ÏûÏ¢ ËÍTAºì»¨ TAµÄ»ØÌû

xueyiran2007

Í­³æ (СÓÐÃûÆø)

ÒýÓûØÌû:
2Â¥: Originally posted by ysshj at 2014-01-10 17:00:14
¿´¼û»Ø/¿´µÍµÄÌû×Ó¾ÍÈ̲»×¡Áô¸öÃû¡£
ÎÒÒ²ÊÇÐÂÊÖ£¬¼ûÎÅÓÐÏÞ£¬ÇóÖ¸µã¡£

H,OµÄatom type·Ö±ðÓÐ2ÖÖ£¬Õâ¸ö¸ú¾ßÌåÄ£ÐÍÓйء£ÓеÄʱºòΪÁË·Ögroup»òÊÇÉèÊÆº¯Êý·½±ã£¬²»Í¬Î»ÖÃͬÖÖÔ­×Ó¿ÉÒÔÉè²»Ò»ÑùµÄatom type¡£

¸ÄÅÅ ...

¶àл£¡ÎÒÊÔÊÔ
LiveandLearn
4Â¥2014-01-11 03:40:18
ÒÑÔÄ   »Ø¸´´ËÂ¥   ¹Ø×¢TA ¸øTA·¢ÏûÏ¢ ËÍTAºì»¨ TAµÄ»ØÌû

xueyiran2007

Í­³æ (СÓÐÃûÆø)

ÒýÓûØÌû:
3Â¥: Originally posted by Èã´ËÎÞÉù at 2014-01-11 00:23:25
1.msÎļþµ¼Èëµ½MEÀbdlת³Édata.
2.fortran±à³ÌʵÏÖ¡£

¶àл£¡´óÉñ£¬Äú¿ÉÒÔ˵µÄÏêϸµãÂð£¿bdlÊÇʲô£¿ÎÒÒѾ­ÓÃmsi2lmpת»»³ÉdataÎļþÁË£¬ÄúµÄÒâ˼ÊÇÓÃbdlÖØÐÂת»»Âð£¿ÁíÍâÈçºÎÀûÓÃfortran±à³ÌʵÏÖ£¿ÊÇͨ¹ý±à³Ì¶ÔdataÎļþ½øÐÐÅÅÐòÂ𣿿ÉÒÔ¸ø¸öÀý×ÓÂð£¿
LiveandLearn
5Â¥2014-01-12 08:36:55
ÒÑÔÄ   »Ø¸´´ËÂ¥   ¹Ø×¢TA ¸øTA·¢ÏûÏ¢ ËÍTAºì»¨ TAµÄ»ØÌû

Èã´ËÎÞÉù

ľ³æ (СÓÐÃûÆø)

¡¾´ð°¸¡¿Ó¦Öú»ØÌû

¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï
xueyiran2007: ½ð±Ò+5, ¡ï¡ï¡ïºÜÓаïÖú 2014-01-13 04:23:31
ÔÂÖ»À¶: ½ð±Ò+2, ¸Ðлָµ¼£¡ 2014-03-12 19:21:39
ÒýÓûØÌû:
5Â¥: Originally posted by xueyiran2007 at 2014-01-12 08:36:55
¶àл£¡´óÉñ£¬Äú¿ÉÒÔ˵µÄÏêϸµãÂð£¿bdlÊÇʲô£¿ÎÒÒѾ­ÓÃmsi2lmpת»»³ÉdataÎļþÁË£¬ÄúµÄÒâ˼ÊÇÓÃbdlÖØÐÂת»»Âð£¿ÁíÍâÈçºÎÀûÓÃfortran±à³ÌʵÏÖ£¿ÊÇͨ¹ý±à³Ì¶ÔdataÎļþ½øÐÐÅÅÐòÂ𣿿ÉÒÔ¸ø¸öÀý×ÓÂð£¿...

msÀïµ¼³öÀ´µÄÎļþÊÇpdb¸ñʽ£¬ÓÃmeÀïµÄת»¯¹¤¾ß¿ÉÒÔ±äΪbdl¸ñʽ¡£bdl¸ñʽÔÙת»¯Îªdata¸ñʽ¾ÍºÃÁË¡£Á˽âÿ¸ö¸ñʽµÄÌØ¶¨µÄ¹æÔò±à³Ì¡£ÎÒÒ²ÐÂÊÖ£¬Ö»ÖªµÀÕâô¶àÁË¡£

[ ·¢×ÔСľ³æ¿Í»§¶Ë ]
ÈËÀàһ˼¿¼£¬Éϵ۾ͷ¢Ð¦¡£
6Â¥2014-01-12 11:20:36
ÒÑÔÄ   »Ø¸´´ËÂ¥   ¹Ø×¢TA ¸øTA·¢ÏûÏ¢ ËÍTAºì»¨ TAµÄ»ØÌû

xueyiran2007

Í­³æ (СÓÐÃûÆø)

ÒýÓûØÌû:
6Â¥: Originally posted by Èã´ËÎÞÉù at 2014-01-12 11:20:36
msÀïµ¼³öÀ´µÄÎļþÊÇpdb¸ñʽ£¬ÓÃmeÀïµÄת»¯¹¤¾ß¿ÉÒÔ±äΪbdl¸ñʽ¡£bdl¸ñʽÔÙת»¯Îªdata¸ñʽ¾ÍºÃÁË¡£Á˽âÿ¸ö¸ñʽµÄÌØ¶¨µÄ¹æÔò±à³Ì¡£ÎÒÒ²ÐÂÊÖ£¬Ö»ÖªµÀÕâô¶àÁË¡£
...

¶àл£¡
LiveandLearn
7Â¥2014-01-13 04:23:43
ÒÑÔÄ   »Ø¸´´ËÂ¥   ¹Ø×¢TA ¸øTA·¢ÏûÏ¢ ËÍTAºì»¨ TAµÄ»ØÌû

huachao90

½û³æ (ÕýʽдÊÖ)

¡ï
ÔÂÖ»À¶: ½ð±Ò+1, ¹ÄÀø½»Á÷£¡ 2014-03-12 19:21:44
±¾ÌûÄÚÈݱ»ÆÁ±Î

8Â¥2014-03-12 18:22:40
ÒÑÔÄ   »Ø¸´´ËÂ¥   ¹Ø×¢TA ¸øTA·¢ÏûÏ¢ ËÍTAºì»¨ TAµÄ»ØÌû

alwynwen

гæ (³õÈëÎÄ̳)

ÇëÎÊÂ¥Ö÷×îºóÊÇÔõô½â¾öÕâ¸öÎÊÌâµÄ£¿Ð»Ð»
9Â¥2014-09-16 19:30:34
ÒÑÔÄ   »Ø¸´´ËÂ¥   ¹Ø×¢TA ¸øTA·¢ÏûÏ¢ ËÍTAºì»¨ TAµÄ»ØÌû
Ïà¹Ø°æ¿éÌø×ª ÎÒÒª¶©ÔÄÂ¥Ö÷ xueyiran2007 µÄÖ÷Ìâ¸üÐÂ
×î¾ßÈËÆøÈÈÌûÍÆ¼ö [²é¿´È«²¿] ×÷Õß »Ø/¿´ ×îºó·¢±í
[¿¼ÑÐ] 281Çóµ÷¼Á£¨0805£© +6 ÑÌÏ«Ò亣 2026-03-16 16/800 2026-03-19 00:59 by ÑÌÏ«Ò亣
[¿¼ÑÐ] 304Çóµ÷¼Á +6 ˾¿Õ. 2026-03-18 6/300 2026-03-18 23:03 by ÐÇ¿ÕÐÇÔÂ
[¿¼ÑÐ] ²ÄÁÏרҵÇóµ÷¼Á +5 hanamiko 2026-03-18 5/250 2026-03-18 20:19 by ÐÇ¿ÕÐÇÔÂ
[¿¼ÑÐ] 0703»¯Ñ§ 305Çóµ÷¼Á +3 FY_yy 2026-03-14 3/150 2026-03-18 19:40 by macy2011
[¿¼ÑÐ] Ò»Ö¾Ô¸ÎäÀí²ÄÁÏ305·ÖÇóµ÷¼Á +5 ÏëÉϰ¶µÄÀðÓã 2026-03-18 6/300 2026-03-18 17:53 by Î޼ʵIJÝÔ­
[¿¼ÑÐ] 286Çóµ÷¼Á +6 lemonzzn 2026-03-16 9/450 2026-03-18 15:31 by vgtyfty
[¿¼ÑÐ] 304Çóµ÷¼Á +12 СÐÜjoy 2026-03-14 13/650 2026-03-18 12:34 by Linda Hu
[¿¼ÑÐ] ÉúÎïѧ071000 329·ÖÇóµ÷¼Á +3 ÎÒ°®ÉúÎïÉúÎﰮΠ2026-03-17 3/150 2026-03-18 10:12 by macy2011
[¿¼ÑÐ] 307Çóµ÷¼Á +3 ÀäóÏ123 2026-03-17 3/150 2026-03-18 09:55 by macy2011
[¿¼ÑÐ] 334Çóµ÷¼Á +3 Ö¾´æ¸ßÔ¶ÒâÔÚ»úÐ 2026-03-16 3/150 2026-03-18 08:34 by lm4875102
[¿¼ÑÐ] ¿¼ÑÐÇóµ÷¼Á +3 éÙËÌ. 2026-03-17 4/200 2026-03-17 21:43 by ÓÐÖ»ÀêÅ«
[¿¼ÑÐ] 085601Çóµ÷¼Á +4 Du.11 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:08 by ruiyingmiao
[¿¼ÑÐ] 278Çóµ÷¼Á +3 Yy7400 2026-03-13 3/150 2026-03-17 08:24 by laoshidan
[¿¼ÑÐ] Ò»Ö¾Ô¸£¬¸£ÖÝ´óѧ²ÄÁÏר˶339·ÖÇóµ÷¼Á +3 ľ×ÓmomoÇàÕù 2026-03-15 3/150 2026-03-17 07:52 by laoshidan
[¿¼ÑÐ] 304Çóµ÷¼Á +5 ËØÄê¼ÀÓï 2026-03-15 5/250 2026-03-16 17:00 by ÎҵĴ¬Îҵĺ£
[¿¼ÑÐ] 283Çóµ÷¼Á +10 С¥¡£ 2026-03-12 14/700 2026-03-16 16:08 by 13811244083
[¿¼ÑÐ] ±¾¿ÆÄϾ©´óѧһ־Ը´¨´óҩѧ327 +3 ÂóÌï¸ûÕß 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:04 by ÍâÐÇÎÄÃ÷
[¿¼ÑÐ] 26µ÷¼Á/²ÄÁÏ¿ÆÑ§Ó빤³Ì/×Ü·Ö295/ÇóÊÕÁô +9 2026µ÷¼ÁÏÀ 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[¿¼ÑÐ] ²ÄÁÏר˶350 Çóµ÷¼Á +4 Íõ½ð¿Æ 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:02 by ruiyingmiao
[¿¼ÑÐ] 290Çóµ÷¼Á +3 ADT 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:19 by peike
ÐÅÏ¢Ìáʾ
ÇëÌî´¦ÀíÒâ¼û