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小肽的质谱分析，真心求助 已有1人参与
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初次接触质谱解析，做2条2肽，用安捷伦Q-TOF MS/MS做，一切都挺好，仪器状态也不错，可出来的二级质谱图把我整郁闷了，附图，有下面几个问题 1、都说肽类y系列和b系列离子碎片是主要的，为什么我的只有y或b离子呢，而且还是y''或b''。 2、没有看见y或b离子，却有y-co2或b-co2离子。这有什么问题吗？ 3、311那个，277.1077真心没法解释，质谱分析提示311.1238是C14H18N2O6加氢峰，247.1066是C13H15N2O3 4、现在我这张二级质谱图有问题吗？会不会我推错了，感觉分子式一定正确，不知道哪出了问题。 当前TOF状态相当好，走标品出来的精确质量非常准，推出的分子式也很准。望大侠指导。  261.1442副本.jpg  311.1230副本.jpg |
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2楼2014-01-05 12:49:24
cpn
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suruiqin: 金币+2, 感谢参与，欢迎常来分析版交流~ 2014-01-06 09:32:51
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Sequence: EL, pI: 3.99987 Fragment Ion Table, monoisotopic masses Seq # B Y # (+1) E 1 130.05046 261.14509 2 L 2 243.13453 132.10250 1 Sequence: EY, pI: 3.99987 Fragment Ion Table, monoisotopic masses Seq # B Y # (+1) E 1 130.05046 311.12436 2 Y 2 293.11379 182.08176 1 http://db.systemsbiology.net/pro ... FragIonServlet.html lz这软件有的离子标错了。 |
3楼2014-01-06 09:18:22
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cpn
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Fragments will only be detected if they carry at least one charge. If this charge is retained on the N terminal fragment, the ion is classed as either a, b or c. If the charge is retained on the C terminal, the ion type is either x, y or z. http://www.matrixscience.com/help/fragmentation_help.html Sequence: EY Seq # B Y # (+1) E 1 130.05046 311.12436 2 Y 2 293.11379 182.08176 1 Sequence: YE Seq # B Y # (+1) Y 1 164.07120 311.12436 2 E 2 293.11379 148.06103 1 EY和YE的b，y离子不一样的。但是，实际情况很有可能是，因为碎裂的很多，还会出来很多其它的碎片峰，lz只能把所有比较显著的峰都给出合理的裂解途径了，才能证明它的连接就是你所希望的连接。。 如果两种同分异构体混在一起了，那这就不是质谱能解决的范围了，至少要在LC能分开了才好定性。 |
5楼2014-01-06 10:01:19
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