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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 化学化工区 » 分析 » 质谱分析 » 小肽的质谱分析，真心求助
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lslsp212

金虫 (小有名气)

[求助] 小肽的质谱分析，真心求助已有1人参与

初次接触质谱解析，做2条2肽，用安捷伦Q-TOF MS/MS做，一切都挺好，仪器状态也不错，可出来的二级质谱图把我整郁闷了，附图，有下面几个问题
1、都说肽类y系列和b系列离子碎片是主要的，为什么我的只有y或b离子呢，而且还是y''或b''。
2、没有看见y或b离子，却有y-co2或b-co2离子。这有什么问题吗？
3、311那个，277.1077真心没法解释，质谱分析提示311.1238是C14H18N2O6加氢峰，247.1066是C13H15N2O3
4、现在我这张二级质谱图有问题吗？会不会我推错了，感觉分子式一定正确，不知道哪出了问题。

当前TOF状态相当好，走标品出来的精确质量非常准，推出的分子式也很准。望大侠指导。
小肽的质谱分析，真心求助
261.1442副本.jpg


小肽的质谱分析，真心求助-1
311.1230副本.jpg
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1楼2014-01-05 11:04:54
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lslsp212

金虫 (小有名气)
自己顶
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2楼2014-01-05 12:49:24
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cpn

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
suruiqin: 金币+2, 感谢参与，欢迎常来分析版交流~ 2014-01-06 09:32:51
lslsp212: 金币+15, ★★★很有帮助 2014-01-06 18:22:08
Sequence: EL,   pI: 3.99987
Fragment Ion Table, monoisotopic masses
Seq    #       B            Y         # (+1)
  E     1    130.05046    261.14509    2
  L     2    243.13453    132.10250    1
Sequence: EY,   pI: 3.99987
Fragment Ion Table, monoisotopic masses
Seq    #       B            Y         # (+1)
  E     1    130.05046    311.12436    2
  Y     2    293.11379    182.08176    1
http://db.systemsbiology.net/pro ... FragIonServlet.html
lz这软件有的离子标错了。
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3楼2014-01-06 09:18:22
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lslsp212

金虫 (小有名气)
内容已删除
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4楼2014-01-06 09:49:01
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cpn

木虫 (正式写手)
Fragments will only be detected if they carry at least one charge. If this charge is retained on the N terminal fragment, the ion is classed as either a, b or c. If the charge is retained on the C terminal, the ion type is either x, y or z.
http://www.matrixscience.com/help/fragmentation_help.html
Sequence: EY
Seq    #       B            Y         # (+1)
  E     1    130.05046    311.12436    2
  Y     2    293.11379    182.08176    1
Sequence: YE
Seq    #       B            Y         # (+1)
  Y     1    164.07120    311.12436    2
  E     2    293.11379    148.06103    1
EY和YE的b，y离子不一样的。但是，实际情况很有可能是，因为碎裂的很多，还会出来很多其它的碎片峰，lz只能把所有比较显著的峰都给出合理的裂解途径了，才能证明它的连接就是你所希望的连接。。
如果两种同分异构体混在一起了，那这就不是质谱能解决的范围了，至少要在LC能分开了才好定性。
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5楼2014-01-06 10:01:19
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