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常小晶

铁虫 (小有名气)

[求助] PCR问题 已有5人参与

最近出现一些问题,PCR总是弥散的情况,也耗时一个月了。不知道给位是否出现过这样的现象,如果有希望能给予一些指导和帮助,不胜感激。鉴于所做的内容比较多,以附件的形式上传,希望大家能费心点开阅读,并群策群力。也看见小木虫上面有这样的现象出现,但是始终没有最终的总结过哪里出现了问题,我也想借这个机会,自己出现的问题进行总结,为以后的学弟学妹们做好总结,避免错误继续发生,令人抓狂。欢迎大家,踊跃讨论,最终解决问题。附件中,也许有表述不清的,请见谅。
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  • 附件 1 : pure_test_--_problem.doc
  • 2014-01-03 10:13:55, 7.61 M

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常小晶

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 大海一孤舟 at 2014-01-03 14:55:25
你的工作做的很全面,对问题的考虑也很全面;但是就PCR这样一个比较成熟的技术来讲,你的研究有些过于复杂化了。在我以前的实验室,PCR条带出现弥散一般都是很容易解决的。
先将我们以前的解决方法表述如下:
1.引 ...

特别感谢您的解答,这是最靠谱和学术的一个。我先说明一下我的实验,由于最近一个月内出现这样的问题,本人稍显焦躁。上传了一个我的报告,也是我的一些拙见,您给一些建议,PCR其实主要只有三个主要部分构成:a 模板的制备 b PCR体系 c PCR程序 d 电泳体系
a,先说模板的制备:我也怀疑是模板的制备有问题,因为这个实验室是新建的,好多东西都可能存在不确定性,模板是最可能存在的问题,包括药品和仪器,这样我用试剂盒提取排除了一些因素。电泳,因为我做的白菜种子,样品很小,DNA含量虽不算很高,但是PCR足矣。排除了模板的问题。
b,PCR体系,PCR酶用的是全式金的,问过他们的销售最近没有市场上有酶问题的反应,我去别的实验室做过,一共两个,进行我的酶体系的实验,显示都没有问题。
c,PCR程序,我所采用的程序是之前很好的程序,所以很长时间我都没有将问题的重点放在这里面。始终觉得可能是引物出了毛病,我重新做的质谱,还有电泳,以及多家公司合成比较,发现问题并没有出现在这里。
d,电泳体系,我把别的实验室的DNA和引物用我们的酶体系以及电泳体系实验,效果很好,所以很多问题都排除了。

最近,我用相同的方法提取另一个白菜的品种的DNA,用另一对引物发现很好,平行实验很好。所以我才觉得可能在某种程度上说是PCR程序的问题。
我看也有很多在小木虫上面提问的,都出现这样的问题,但是最后都没有回答是怎样解决的,呵呵,所以很好奇,如果有出现这样情况的,聊一聊,对以后也有帮助,仅此而已。谢谢
9楼2014-01-03 16:12:19
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yang0071

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你的老师呢?
师兄师姐呢?
这么长的,谁看的下去
2楼2014-01-03 11:10:24
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冷雁孤旅

木虫 (著名写手)

英文写的 不错  谢谢楼主了 楼主辛苦了
生命不息奋斗不止
3楼2014-01-03 12:49:37
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zhaolf

木虫 (著名写手)

胖虎爱唱歌

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我的妈呀,我都不知道我为什么要下载,还仔细阅读了。同学,我很佩服你解决问题的意志力,我还很佩服你的勇气,敢用英文来写,而且,英文真的是差得有水平啊。唉,我不知道该咋说了,几乎每句话都有语法用词的错误。我要是认识你,真想把你揪过来一句话一句话给你改。
回到实验上来,我本人也是做了很多很多PCR的,有时候明明做的结果还不错,换了别的样品结果就很差,往往都是引物不太好引起的,或者引物工作条件比较苛刻,稍有不慎结果就很差。
我是胖虎,我是孩子王!
4楼2014-01-03 13:45:35
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