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常小晶

铁虫 (小有名气)

[求助] PCR问题 已有5人参与

最近出现一些问题,PCR总是弥散的情况,也耗时一个月了。不知道给位是否出现过这样的现象,如果有希望能给予一些指导和帮助,不胜感激。鉴于所做的内容比较多,以附件的形式上传,希望大家能费心点开阅读,并群策群力。也看见小木虫上面有这样的现象出现,但是始终没有最终的总结过哪里出现了问题,我也想借这个机会,自己出现的问题进行总结,为以后的学弟学妹们做好总结,避免错误继续发生,令人抓狂。欢迎大家,踊跃讨论,最终解决问题。附件中,也许有表述不清的,请见谅。
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  • 附件 1 : pure_test_--_problem.doc
  • 2014-01-03 10:13:55, 7.61 M

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zhaolf

木虫 (著名写手)

胖虎爱唱歌

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我的妈呀,我都不知道我为什么要下载,还仔细阅读了。同学,我很佩服你解决问题的意志力,我还很佩服你的勇气,敢用英文来写,而且,英文真的是差得有水平啊。唉,我不知道该咋说了,几乎每句话都有语法用词的错误。我要是认识你,真想把你揪过来一句话一句话给你改。
回到实验上来,我本人也是做了很多很多PCR的,有时候明明做的结果还不错,换了别的样品结果就很差,往往都是引物不太好引起的,或者引物工作条件比较苛刻,稍有不慎结果就很差。
我是胖虎,我是孩子王!
4楼2014-01-03 13:45:35
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yang0071

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你的老师呢?
师兄师姐呢?
这么长的,谁看的下去
2楼2014-01-03 11:10:24
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冷雁孤旅

木虫 (著名写手)

英文写的 不错  谢谢楼主了 楼主辛苦了
生命不息奋斗不止
3楼2014-01-03 12:49:37
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大海一孤舟

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+10, 鼓励交流! 2014-01-04 00:30:24
gyesang: 回帖置顶 2014-01-04 00:30:47
你的工作做的很全面,对问题的考虑也很全面;但是就PCR这样一个比较成熟的技术来讲,你的研究有些过于复杂化了。在我以前的实验室,PCR条带出现弥散一般都是很容易解决的。
先将我们以前的解决方法表述如下:
1.引物问题,这个一般是针对新合成的引物,对于已经成功做出实验的就不会过多考虑;如果新引物在一般条件没有获得很好的扩增(这个一般会用标准的质粒模板),通过梯度温度PCR仍然没有很好的扩增,那么就可以考虑重新设计引物。不过基于现在引物设计软件的强大功能,一般的引物不会出现问题,除非扩增的目的产物有很明显的特殊性。
2.样品问题,在引物没有问题的前提下,样品存在问题的可能性很高。作为模板的样品,在添加进PCR体系时很可能对整个的PCR体系产生影响;改变体系的PH,引入DNA酶的抑制物等等;一般建议PCR模板样品是直接用水溶解的,样品中不要含有太多的蛋白质杂质.
3.实验仪器和实验试剂的问题,这个两样一般不会出现问题,一台仪器要是有问题就把以前做的很好的样品作为对照就能解决啦;同理实验试剂也是的。
4.电泳问题,当然这个问题很好说明,直接看你的Maker条带是否清晰就行。
总结一下你的实验:
从你的实验数据看,你已经有过成功的实验,这样的话你仪器,试剂,电泳应该都是没有问题;主要的问题就是在的模板样品上面。
希望上面的分析对你的实验有帮助。
5楼2014-01-03 14:55:25
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