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lingbi

银虫 (正式写手)

[求助] 自己画质粒图,启动子的方向弄不明白 已有1人参与

正在学习质粒制图软件,有两个问题。
1、常见质粒图PET28a NCBI上查不到空质粒信息,都是改造后的,这样就不能直接导入软件了,有没有其他方式获得背景信息(可以直接导入软件的)

2、我目前有PET28a 的序列,以及一些启动子、终止子的位置信息,可是从中看不懂它的方向性?T7 promoter 370-386 是顺时针的意思吗?麻烦哪位高手给指指。

3、PET28a 怎么两个复制子?(f1   PBR322)分别什么时候用?

pET-28a(+) sequence landmarks
T7 promoter 370-386
T7 transcription start 369
His•Tag coding sequence 270-287
T7•Tag coding sequence 207-239
Multiple cloning sites
(BamH I - XhoI) 158-203
His•Tag coding sequence 140-157
T7 terminator 26-72
lacIcoding sequence 773-1852
pBR322 origin 3286
Kan coding sequence 3995-4807
f1 origin 4903-5358
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lingbi

银虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-12-30 17:51:43
不知道你用什么软件画,一般的软件都有输入序列,标记各个元件的功能吧。我在用VECTOR NTI,我觉得是比较好用的软件。...

我本来也有的,这个软件好用,可是头几天突然打不开了,而且也重装不上了!!郁闷,刚学习了GCK软件,发现导入之后就是一个圆环,所有的东东都要自己画上去,不知道是我用复杂了,还是怎么的。还有什么方便的软件吗?
5楼2013-12-30 22:07:54
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2013-12-29 17:23:33
lingbi: 金币+2, 有帮助 2013-12-30 22:08:28
卖质粒的公司网站上有质粒图谱,自己查询。
2楼2013-12-29 12:34:51
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lingbi

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-12-29 12:34:51
卖质粒的公司网站上有质粒图谱,自己查询。

知道要查的。你的说法是,我下载了序列,然后看公司网站上的图片位点标记的方向照着画是吗?

有更简单的办法吗?
3楼2013-12-30 14:51:09
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lingbi at 2013-12-30 14:51:09
知道要查的。你的说法是,我下载了序列,然后看公司网站上的图片位点标记的方向照着画是吗?

有更简单的办法吗?...

不知道你用什么软件画,一般的软件都有输入序列,标记各个元件的功能吧。我在用VECTOR NTI,我觉得是比较好用的软件。
4楼2013-12-30 17:51:43
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