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liu_chen_na新虫 (初入文坛)
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蛋白柔性残基设置之后非整数电荷问题？
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请教大家一个问题： Autodock4: Flexible residues项中把蛋白中ASP,GLU等氨基酸设置为柔性残基，然后分别保存为_flex.pdbqt和_rigid.pdbqt文件，但这两个pdbqt文件中ASP,GLU等氨基酸是不完整的，它们所带的电荷也不为整数，之后Grid项中Macromolecule打开_rigid.pdbqt文件也提示有氨基酸带非整数电荷，蛋白非整数电荷。 请问下这种情况该怎么处理，不处理对对接结果有何影响？ 此外，Grid项中Get map tpyes中需要选择Choose flexresidue吗？中文教程上没有选择。 |
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