| 查看: 398 | 回复: 0 | ||
liu_chen_na新虫 (初入文坛)
|
[求助]
蛋白柔性残基设置之后非整数电荷问题？
|
|
请教大家一个问题： Autodock4: Flexible residues项中把蛋白中ASP,GLU等氨基酸设置为柔性残基，然后分别保存为_flex.pdbqt和_rigid.pdbqt文件，但这两个pdbqt文件中ASP,GLU等氨基酸是不完整的，它们所带的电荷也不为整数，之后Grid项中Macromolecule打开_rigid.pdbqt文件也提示有氨基酸带非整数电荷，蛋白非整数电荷。 请问下这种情况该怎么处理，不处理对对接结果有何影响？ 此外，Grid项中Get map tpyes中需要选择Choose flexresidue吗？中文教程上没有选择。 |
回复此楼» 猜你喜欢
存款400万可以在学校里躺平吗
已经有15人回复
-
拟解决的关键科学问题还要不要写
已经有6人回复
-
Materials Today Chemistry审稿周期
已经有6人回复
-
基金委咋了？2026年的指南还没有出来？
已经有10人回复
-
基金申报
已经有6人回复
-
推荐一本书
已经有13人回复
-
国自然申请面上模板最新2026版出了吗？
已经有17人回复
-
纳米粒子粒径的测量
已经有8人回复
-
疑惑？
已经有5人回复
-
计算机、0854电子信息（085401-058412）调剂
已经有5人回复
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
刚性蛋白中氨基酸有非整数电荷，如何处理？
已经有4人回复
- 蛋白质的电荷不为整数问题
已经有3人回复
- NaCl可以屏蔽蛋白分子上的赖氨酸和精氨酸残基的正电荷的原理
已经有7人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人