| 查看: 1635 | 回复: 6 | ||
gunther金虫 (初入文坛)
|
[求助]
ubuntu运行vasp5.3.3出错
|
|
大家好，我的系统是64位ubuntu，cpu是i5-3470（四核四线程），内存8G，安装的是并行的vasp5.3.3，低精度可以正常计算，但是高精度时vasp运行十秒左右的时候就被ubuntu杀了，这时候内存总占用是30%多一点。我的INCAR如下： PREC = Accurate ENCUT = 900 KGAMA = T KSPACING = 0.5 EDIFF = 1e-5 IBRION = 2 ISIF = 3 NSW = 80 ISMEAR = 0 ; SIGMA = 0.05 POTIM = 0.05 LWAVE = FALSE LCHARG = FALSE PSTRESS = 500 EDIFFG = 1e-4 NPAR = 2 NCOR = 2 输出文件里这样提示错误： entering main loop N E dE d eps ncg rms rms(c) rank 3 in job 17 ubuntu_46776 caused collective abort of all ranks exit status of rank 3: killed by signal 9 rank 1 in job 17 ubuntu_46776 caused collective abort of all ranks exit status of rank 1: killed by signal 9 师兄说这可能是内存溢出导致的，他让我执行如下命令： ulimit -c unlimited ulimit -d unlimited ulimit -m unlimited ulimit -t unlimited ulimit -v unlimited ulimit -s unlimited 但是还是不好使，哪位大神帮忙指教一下哈？ |
回复此楼» 猜你喜欢
293求调剂
已经有5人回复
-
290求调剂
已经有10人回复
-
285化工学硕求调剂（081700）
已经有8人回复
-
211本，11408一志愿中科院277分，曾在中科院自动化所实习
已经有5人回复
-
材料与化工304求B区调剂
已经有8人回复
-
有没有大佬发小论文能带我个二作
已经有4人回复
-
考研调剂
已经有5人回复
-
267一志愿南京工业大学0817化工求调剂
已经有6人回复
-
293求调剂
已经有4人回复
-
302求调剂
已经有8人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Linux & Ubuntu 安装与使用手册（3个文件）
已经有15人回复
- linux下运行gaussian输出文件内容出错 Entering Gaussian System,，，
已经有7人回复
- gromacs安装出错求助
已经有4人回复
- 想把xp换成ubuntu。大家有啥建议啊？
已经有10人回复
- ubuntu12.04下，装espresso-5.0.1.时，出问题了。
已经有9人回复
- 安装ubuntu时找不到空闲分区
已经有20人回复
- abinit 在Ubuntu系统下怎么安装？
已经有9人回复
- ubuntu中如何进入usr?
已经有5人回复
- ubuntu在国内应用较多的地方
已经有5人回复
- ifort出现问题！求教！
已经有16人回复
- Autodock在Ubuntu下的安装问题
已经有7人回复
- 电脑装一个ubuntu系统做 数值计算？
已经有11人回复
- 求助ubuntu下maui的安装配置
已经有5人回复
- vasp5.2的编译问题 非常感谢 ！！
已经有14人回复
- 【讨论】弱弱的问一句，为什么ubuntu不适合做autodock的操作系统
已经有13人回复
- 【求助】运行linsence有问题。如何装我的MS5.5 ？？
已经有6人回复
- 【求助成功】求ubuntu中vasp程序安装最后一步出错！！郁闷！！！
已经有12人回复
- ubuntu如何给pdf文献做笔记
已经有5人回复
- 【求助】ubuntu中安装高斯
已经有18人回复
- 【原创】Ubuntu 9.04下MPICH2集群搭建
已经有8人回复
emilyoyang
木虫 (正式写手)
- 应助: 232 (大学生)
- 金币: 4340.4
- 红花: 42
- 帖子: 667
- 在线: 189.9小时
- 虫号: 1630291
- 注册: 2012-02-20
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
2楼2013-12-10 10:59:55
gunther
金虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 831.6
- 帖子: 38
- 在线: 233小时
- 虫号: 1705329
- 注册: 2012-03-20
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
3楼2013-12-10 16:21:48
chuanghua304
禁虫 (职业作家)
★
感谢参与，应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 系诶些交流 2013-12-13 10:17:10
感谢参与，应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 系诶些交流 2013-12-13 10:17:10
|
本帖内容被屏蔽 |
4楼2013-12-10 18:52:25
gunther
金虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 831.6
- 帖子: 38
- 在线: 233小时
- 虫号: 1705329
- 注册: 2012-03-20
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
5楼2013-12-10 19:04:15
chuanghua304
禁虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-12-13 10:17:20
gunther: 金币+8, ★★★很有帮助, 谢谢热心回复 2013-12-14 18:29:25
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-12-13 10:17:20
gunther: 金币+8, ★★★很有帮助, 谢谢热心回复 2013-12-14 18:29:25
|
本帖内容被屏蔽 |
6楼2013-12-11 09:14:38
gunther
金虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 831.6
- 帖子: 38
- 在线: 233小时
- 虫号: 1705329
- 注册: 2012-03-20
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
7楼2013-12-12 08:36:15
