| 查看: 1797 | 回复: 6 | ||
gunther金虫 (初入文坛)
|
[求助]
ubuntu运行vasp5.3.3出错
|
|
大家好,我的系统是64位ubuntu,cpu是i5-3470(四核四线程),内存8G,安装的是并行的vasp5.3.3,低精度可以正常计算,但是高精度时vasp运行十秒左右的时候就被ubuntu杀了,这时候内存总占用是30%多一点。我的INCAR如下: PREC = Accurate ENCUT = 900 KGAMA = T KSPACING = 0.5 EDIFF = 1e-5 IBRION = 2 ISIF = 3 NSW = 80 ISMEAR = 0 ; SIGMA = 0.05 POTIM = 0.05 LWAVE = FALSE LCHARG = FALSE PSTRESS = 500 EDIFFG = 1e-4 NPAR = 2 NCOR = 2 输出文件里这样提示错误: entering main loop N E dE d eps ncg rms rms(c) rank 3 in job 17 ubuntu_46776 caused collective abort of all ranks exit status of rank 3: killed by signal 9 rank 1 in job 17 ubuntu_46776 caused collective abort of all ranks exit status of rank 1: killed by signal 9 师兄说这可能是内存溢出导致的,他让我执行如下命令: ulimit -c unlimited ulimit -d unlimited ulimit -m unlimited ulimit -t unlimited ulimit -v unlimited ulimit -s unlimited 但是还是不好使,哪位大神帮忙指教一下哈? |
» 猜你喜欢
前几天时间戳更新了
已经有15人回复
三区计算机方向期刊推荐
已经有5人回复
有谁可曾问过你过的还好吗?
已经有11人回复
一篇论文同时出现在两个期刊,一模一样,这算不算学术不端,请各位老师斧正。
已经有6人回复
申博
已经有5人回复
希望面上有个好结果
已经有6人回复
sci论文二审求助
已经有5人回复
今年也是没消息就是没中么
已经有13人回复
咸菜
已经有6人回复
函评
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
Linux & Ubuntu 安装与使用手册(3个文件)
已经有15人回复
linux下运行gaussian输出文件内容出错 Entering Gaussian System,,,
已经有7人回复
gromacs安装出错求助
已经有4人回复
想把xp换成ubuntu。大家有啥建议啊?
已经有10人回复
ubuntu12.04下,装espresso-5.0.1.时,出问题了。
已经有9人回复
安装ubuntu时找不到空闲分区
已经有20人回复
abinit 在Ubuntu系统下怎么安装?
已经有9人回复
ubuntu中如何进入usr?
已经有5人回复
ubuntu在国内应用较多的地方
已经有5人回复
ifort出现问题!求教!
已经有16人回复
Autodock在Ubuntu下的安装问题
已经有7人回复
电脑装一个ubuntu系统做 数值计算?
已经有11人回复
求助ubuntu下maui的安装配置
已经有5人回复
vasp5.2的编译问题 非常感谢 !!
已经有14人回复
【讨论】弱弱的问一句,为什么ubuntu不适合做autodock的操作系统
已经有13人回复
【求助】运行linsence有问题。如何装我的MS5.5 ??
已经有6人回复
【求助成功】求ubuntu中vasp程序安装最后一步出错!!郁闷!!!
已经有12人回复
ubuntu如何给pdf文献做笔记
已经有5人回复
【求助】ubuntu中安装高斯
已经有18人回复
【原创】Ubuntu 9.04下MPICH2集群搭建
已经有8人回复

emilyoyang
木虫 (正式写手)
- 应助: 232 (大学生)
- 金币: 4340.4
- 红花: 42
- 帖子: 667
- 在线: 189.9小时
- 虫号: 1630291
- 注册: 2012-02-20
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
2楼2013-12-10 10:59:55
gunther
金虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 831.6
- 帖子: 38
- 在线: 233小时
- 虫号: 1705329
- 注册: 2012-03-20
- 专业: 凝聚态物性 II :电子结构

3楼2013-12-10 16:21:48
chuanghua304
禁虫 (职业作家)
★
感谢参与,应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 系诶些交流 2013-12-13 10:17:10
感谢参与,应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 系诶些交流 2013-12-13 10:17:10
|
本帖内容被屏蔽 |
4楼2013-12-10 18:52:25
gunther
金虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 831.6
- 帖子: 38
- 在线: 233小时
- 虫号: 1705329
- 注册: 2012-03-20
- 专业: 凝聚态物性 II :电子结构

5楼2013-12-10 19:04:15
chuanghua304
禁虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-12-13 10:17:20
gunther: 金币+8, ★★★很有帮助, 谢谢热心回复 2013-12-14 18:29:25
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-12-13 10:17:20
gunther: 金币+8, ★★★很有帮助, 谢谢热心回复 2013-12-14 18:29:25
|
本帖内容被屏蔽 |
6楼2013-12-11 09:14:38
gunther
金虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 831.6
- 帖子: 38
- 在线: 233小时
- 虫号: 1705329
- 注册: 2012-03-20
- 专业: 凝聚态物性 II :电子结构

7楼2013-12-12 08:36:15










回复此楼