| 查看: 1634 | 回复: 6 | ||
gunther金虫 (初入文坛)
|
[求助]
ubuntu运行vasp5.3.3出错
|
|
大家好，我的系统是64位ubuntu，cpu是i5-3470（四核四线程），内存8G，安装的是并行的vasp5.3.3，低精度可以正常计算，但是高精度时vasp运行十秒左右的时候就被ubuntu杀了，这时候内存总占用是30%多一点。我的INCAR如下： PREC = Accurate ENCUT = 900 KGAMA = T KSPACING = 0.5 EDIFF = 1e-5 IBRION = 2 ISIF = 3 NSW = 80 ISMEAR = 0 ; SIGMA = 0.05 POTIM = 0.05 LWAVE = FALSE LCHARG = FALSE PSTRESS = 500 EDIFFG = 1e-4 NPAR = 2 NCOR = 2 输出文件里这样提示错误： entering main loop N E dE d eps ncg rms rms(c) rank 3 in job 17 ubuntu_46776 caused collective abort of all ranks exit status of rank 3: killed by signal 9 rank 1 in job 17 ubuntu_46776 caused collective abort of all ranks exit status of rank 1: killed by signal 9 师兄说这可能是内存溢出导致的，他让我执行如下命令： ulimit -c unlimited ulimit -d unlimited ulimit -m unlimited ulimit -t unlimited ulimit -v unlimited ulimit -s unlimited 但是还是不好使，哪位大神帮忙指教一下哈？ |
回复此楼» 猜你喜欢
308求调剂
已经有4人回复
-
NSFC申报书里申请人简历中代表性论著还需要在申报书最后的附件里面再上传一遍吗
已经有14人回复
-
材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐
已经有6人回复
-
化学调剂0703
已经有7人回复
-
327求调剂
已经有11人回复
-
调剂
已经有8人回复
-
梁成伟老师课题组欢迎你的加入
已经有7人回复
-
伙伴们，祝我生日快乐吧
已经有24人回复
-
中科院材料273求调剂
已经有3人回复
-
材料工程专硕274一志愿211求调剂
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Linux & Ubuntu 安装与使用手册（3个文件）
已经有15人回复
- linux下运行gaussian输出文件内容出错 Entering Gaussian System,，，
已经有7人回复
- gromacs安装出错求助
已经有4人回复
- 想把xp换成ubuntu。大家有啥建议啊？
已经有10人回复
- ubuntu12.04下，装espresso-5.0.1.时，出问题了。
已经有9人回复
- 安装ubuntu时找不到空闲分区
已经有20人回复
- abinit 在Ubuntu系统下怎么安装？
已经有9人回复
- ubuntu中如何进入usr?
已经有5人回复
- ubuntu在国内应用较多的地方
已经有5人回复
- ifort出现问题！求教！
已经有16人回复
- Autodock在Ubuntu下的安装问题
已经有7人回复
- 电脑装一个ubuntu系统做 数值计算？
已经有11人回复
- 求助ubuntu下maui的安装配置
已经有5人回复
- vasp5.2的编译问题 非常感谢 ！！
已经有14人回复
- 【讨论】弱弱的问一句，为什么ubuntu不适合做autodock的操作系统
已经有13人回复
- 【求助】运行linsence有问题。如何装我的MS5.5 ？？
已经有6人回复
- 【求助成功】求ubuntu中vasp程序安装最后一步出错！！郁闷！！！
已经有12人回复
- ubuntu如何给pdf文献做笔记
已经有5人回复
- 【求助】ubuntu中安装高斯
已经有18人回复
- 【原创】Ubuntu 9.04下MPICH2集群搭建
已经有8人回复
emilyoyang
木虫 (正式写手)
- 应助: 232 (大学生)
- 金币: 4340.4
- 红花: 42
- 帖子: 667
- 在线: 189.9小时
- 虫号: 1630291
- 注册: 2012-02-20
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
2楼2013-12-10 10:59:55
gunther
金虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 831.6
- 帖子: 38
- 在线: 233小时
- 虫号: 1705329
- 注册: 2012-03-20
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
3楼2013-12-10 16:21:48
chuanghua304
禁虫 (职业作家)
★
感谢参与，应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 系诶些交流 2013-12-13 10:17:10
感谢参与，应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 系诶些交流 2013-12-13 10:17:10
|
本帖内容被屏蔽 |
4楼2013-12-10 18:52:25
gunther
金虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 831.6
- 帖子: 38
- 在线: 233小时
- 虫号: 1705329
- 注册: 2012-03-20
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
5楼2013-12-10 19:04:15
chuanghua304
禁虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-12-13 10:17:20
gunther: 金币+8, ★★★很有帮助, 谢谢热心回复 2013-12-14 18:29:25
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-12-13 10:17:20
gunther: 金币+8, ★★★很有帮助, 谢谢热心回复 2013-12-14 18:29:25
|
本帖内容被屏蔽 |
6楼2013-12-11 09:14:38
gunther
金虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 831.6
- 帖子: 38
- 在线: 233小时
- 虫号: 1705329
- 注册: 2012-03-20
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
7楼2013-12-12 08:36:15
