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369538425金虫 (小有名气)
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[求助]
如何制作heatmap图
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我做了生物芯片（小鼠）处理组3张芯片还有对照组3张芯片，现在要写文章做heatmap图。但是遇到了问题，向大家求助。（mRNA和microRNA, treeview和cluster作图） 关于做heatmap中的数值问题我不明白是表达值还是比值。如何来确定是上调还是下调？ 如果是表达值得的话，那比照什么值来看高表达和低表达啊？比如说，A基因 control值：180, 处理值：50。而B基因control值490；处理值2000.这种情况下哪个算高表达，哪个算低表达啊。（PS，我之前把表达值导出cluster,treeview, 一片红啊~~） 如果是比值的话，是跟谁比啊，要是处理跟对照比，那我这就没有文献中的那种处理组和对照组了。 还是说表达值的数据需要怎么处理一下才能得到这种效果。 求大神指点啊……急求~~跪求~~ |
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